·常規(guī)信息  最近更新:2022年12月11日 17:08:00
                基因(座)名稱每穗實(shí)粒數(shù)基因; 細(xì)胞分裂素氧化酶/脫氫酶
                grain number; cytokinin oxidase/dehydrogenase
                基因符號(hào)Gn1a; OsCKX2
                所在染色體1 (已克隆)

                OsCKX2(Os01g0197700, Rong et al. 2022)...

                Gn1a 位點(diǎn),是影響水稻每穗實(shí)粒數(shù)的主效QTL,來(lái)自品種Habataki 的等位基因增加了每穗粒數(shù)。

                【突變體表型】

                與野生型日本晴相比,單突材料ckx2的頂端3葉顯得長(zhǎng)而寬,基部節(jié)間增粗,千粒重增加,株高、分蘗數(shù)、每穗穎花數(shù)、結(jié)實(shí)率無(wú)顯著變化,單株穗數(shù)降低,單株產(chǎn)量無(wú)明顯變化。兩種雙突材料ckx1 ckx2的一次枝梗數(shù)和每穗穎花數(shù)增加,但單株分蘗數(shù)、單株穗數(shù)和結(jié)實(shí)率降低,導(dǎo)致單株產(chǎn)量下降。此外,ckx1 ckx2-19的粒長(zhǎng)和千粒重顯著增加,但粒寬和粒厚沒(méi)有顯著變化;植株的旗葉也更寬,基部節(jié)間更厚,但株高無(wú)顯著變化?傊,CKX1CKX2的雙敲除可能有助于提高水稻的抗倒伏性和優(yōu)化株型(Rong et al. 2022)。

                【定位與克隆】

                日本名古屋大學(xué)Matsuoka研究組利用秈粳交Habataki/Koshihikari,在第1染色體短臂上定位到一個(gè)控制粒數(shù)的QTL-Gn1,可以解釋44%的表型變異。進(jìn)一步利用NIL-Gn1的雜合植株(Gn1/gn1)產(chǎn)生的96個(gè)F2單株,將Gn1分解為兩個(gè)位點(diǎn):Gn1aGn1b,這兩個(gè)位點(diǎn)的效應(yīng)相當(dāng),Gn1a定位于R3192和C12072S之間不到2cM的區(qū)間,Gn1b位于Gn1a的上游(Ashikari et al. 2005)。

                利用NIL-Gn1a的雜合植株(Gn1a/gn1a)產(chǎn)生的13000 個(gè)F2 單株,將Gn1a 精細(xì)定位于3A28和3A20之間6.3kb的區(qū)域,該區(qū)域只有一個(gè)開放閱讀框,即與細(xì)胞分裂素氧化酶/脫氫酶高度同源的OsCKX2 基因。序列分析表明,與Koshihikari 相比,Habataki 中OsCKX2 基因在5' 非翻譯區(qū)和第1個(gè)外顯子上分別缺失16個(gè)和6個(gè)堿基,而且第4外顯子發(fā)生了3個(gè)堿基的置換,這些導(dǎo)致了其蛋白產(chǎn)物的差異(Ashikari et al., 2005)。

                【時(shí)空表達(dá)譜】

                OsCKX2通常在側(cè)根原基、葉片、葉鞘、莖基部和穗中表達(dá)水平較高(Rong et al. 2022)。

                OsCKX2 在葉片、莖、花序分生組織和花中表達(dá)強(qiáng)烈,在莖尖分生組織表達(dá)較弱,而在根與胚中不表達(dá)。

                【生物學(xué)功能】

                測(cè)序結(jié)果暗示了OsCKX2 功能的降低或缺失將提高稻谷的產(chǎn)量,互補(bǔ)轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)也表明OsCKX2 就是Gn1a 。由于OsCKX2 表達(dá)量的降低引起花序分裂組織中細(xì)胞分裂素的積累,因而增加了穎花數(shù)量,即粒數(shù),最終導(dǎo)致產(chǎn)量提高(Ashikari et al., 2005)。

                OsER1作用于OsMKKK10-OsMKK4-OsMPK6級(jí)聯(lián)信號(hào)上游,與OsMKKK10OsMKK4聯(lián)合調(diào)控OsMPK6磷酸化水平,通過(guò)調(diào)控局部細(xì)胞分裂代謝參與水稻穗部形態(tài)建成,是每穗粒數(shù)的負(fù)調(diào)控因子。此外,OsMPK6能與DST互作并將其磷酸化,從而增強(qiáng)DST對(duì)下游細(xì)胞分裂素氧化酶基因OsCKX2的轉(zhuǎn)錄激活能力,促進(jìn)幼穗發(fā)育過(guò)程中細(xì)胞分裂素降解,維持細(xì)胞分裂素正常水平。因此,OsER1-OsMKKK10-OsMKK4-OsMPK6信號(hào)通路在遺傳上依賴于DST-OsCKX2調(diào)控模塊,通過(guò)維持幼穗中細(xì)胞分裂素內(nèi)穩(wěn)態(tài)影響水稻幼穗發(fā)育,最終決定每穗粒數(shù)形成(Guo et al. 2020)。

                無(wú)功能的gn1aR498,是重穗型恢復(fù)系蜀恢498每穗粒數(shù)增加的決定因素(Wang et al. 2018)。此外,gn1aR498通過(guò)增加莖粗和促進(jìn)冠狀根發(fā)育,提高水稻的抗倒伏能力。gn1aR498與另2個(gè)增益等位基因SCM2SCM3聚合,能進(jìn)一步提高抗倒性。Gn1a/OsCKX2功能喪失導(dǎo)致細(xì)胞分裂素在根尖積累,促進(jìn)不定根發(fā)育。gn1aR498對(duì)品質(zhì)幾乎無(wú)影響(Tu et al. 2022)。

                下調(diào)OsCKX2表達(dá),增加了分蘗數(shù)并提高了水稻產(chǎn)量(Yeh et al. 2015)。

                OsCKX2在水稻基部節(jié)間、分蘗、葉片、穗和籽粒的生長(zhǎng)發(fā)育中起作用,負(fù)調(diào)控莖粗、葉長(zhǎng)葉寬、穗和籽粒大小,正調(diào)控分蘗(Rong et al. 2022)。

                【評(píng)注】

                OsCKX2(Gn1a)基因編碼一種降解細(xì)胞分裂素的酶,該基因表達(dá)的減弱,使得細(xì)胞分裂素在花序分生組織中累積,增加繁殖器官的數(shù)目,穗粒數(shù)就越多,最終提高水稻的產(chǎn)量。

                【相關(guān)登錄號(hào)】
                contigs及其產(chǎn)物:AP003200BAB89407, AP003244BAB56095, AP014957BAS70876
                cDNAs及其產(chǎn)物:AB205193BAE16612, AK243684BAH01708, AK289178
                參考基因組位點(diǎn):Os01g0197700(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os01g10110(本地MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4327333(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015773930XP_015629416
                uniprot庫(kù)登錄號(hào):Q4ADV8
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                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征葉寬(TO:0000370), 葉長(zhǎng)(TO:0000135), 分蘗數(shù)(TO:0000346), 單株穗數(shù)(TO:0000152), 每穗實(shí)粒數(shù)(TO:0000447), 結(jié)實(shí)率(TO:0000448), 粒長(zhǎng)(TO:0000734), 抗倒性(TO:0000068), 細(xì)胞分裂素含量(TO:0002660), 莖粗(TO:0000339), 千粒重(TO:0000592), 一次枝梗數(shù)(TO:0000547), 單株產(chǎn)量(TO:0000449)
                分子功能細(xì)胞分裂素脫氫酶(GO:0019139)
                生物進(jìn)程細(xì)胞分裂調(diào)控(GO:0051302), 穗形態(tài)建成(GO:0048281), 節(jié)間發(fā)育模式建成(GO:0080006), 不定根發(fā)育(GO:0048830), 有絲分裂調(diào)控(GO:0007346), 分蘗形成調(diào)控(GO:2000032), 細(xì)胞增殖調(diào)控(GO:0042127), 細(xì)胞分裂素分解(GO:0009823), 葉發(fā)育調(diào)控(GO:2000024)
                ·參考文獻(xiàn)
                1Chenyu Rong;Yuexin Liu;Zhongyuan Chang;Ziyu Liu;Yanfeng Ding;Chengqiang Ding
                  Cytokinin oxidase/dehydrogenase family genes exhibit functional divergence and overlap in rice growth and development, especially in control of tillering
                  Journal of Experimental Botany, 2022, 73(11): 3552-3568
                2Bin Tu;Zhang Tao;Shiguang Wang;Lei Zhou;Ling Zheng;Chun Zhang;Xinzi Li;Xiaoyu Zhang;Junjie Yin;Xiaobo Zhu;Hua Yuan;Ting Li;Weilan Chen;Peng Qin;Bingtian Ma;Yuping Wang;Shigui Li
                  Loss of Gn1a/OsCKX2 confers heavy-panicle rice with excellent lodging resistance
                  Journal of Integrative Plant Biology, 2021, 
                3Tao Guo;Zi-Qi Lu;Jun-Xiang Shan;Wang-Wei Ye;Nai-Qian Dong;Hong-Xuan Lin
                  ERECTA1 Acts Upstream of the OsMKKK10-OsMKK4-OsMPK6 Cascade to Control Spikelet Number by Regulating Cytokinin Metabolism in Rice
                  The Plant Cell, 2020, 32(9): 2763-2779
                4Shiguang Wang;Bingtian Ma;Qiang Gao;Guojing Jiang;Lei Zhou;Bin Tu;Peng Qin;Xueqin Tan;Peixiong Liu;Yunhai Kang;Yuping Wang;Weilan Chen;Chengzhi Liang;Shigui Li
                  Dissecting the genetic basis of heavy panicle hybrid rice uncovered Gn1a and GS3 as key genes
                  Theoretical and Applied Genetics, 2018, 131(6): 1391-1403
                5Su-Ying Yeh;Hau-Wen Chen;Chun-Yeung Ng;Chu-Yin Lin;Tung-Hai Tseng;Wen-Hsiung Li;Maurice S. B. Ku
                  Down-Regulation of Cytokinin Oxidase 2 Expression Increases Tiller Number and Improves Rice Yield
                  Rice, 2015, 8: 36
                6Shuyu Li;Bingran Zhao;Dingyang Yuan;Meijuan Duan;Qian Qian;Li Tang;Bao Wang;Xiaoqiang Liu;Jie Zhang;Jun Wang;Jiaqiang Sun;Zhao Liu;Yu-Qi Feng;Longping Yuan;Chuanyou Li
                  Rice zinc finger protein DST enhances grain production through controlling Gn1a/OsCKX2 expression
                  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2013, 110(8): 3167-3172
                7Motoyuki Ashikari;Hitoshi Sakakibara;Shaoyang Lin;Toshio Yamamoto;Tomonori Takashi;Asuka Nishimura;Enrique R. Angeles;Qian Qian;Hidemi Kitano;Makoto Matsuoka
                  Cytokinin Oxidase Regulates Rice Grain Production
                  Science, 2005, 309(741): 741-745
                中國(guó)水稻研究所
                Copyright © CNRRI. All rights reserved. 中國(guó)水稻研究所 版權(quán)所有
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