·常規(guī)信息  最近更新:2023年10月13日 13:24:00
                基因(座)名稱RING型E3泛素連接酶; 粒寬和粒重主效控制基因
                RING-type E3 ubiquitin ligase; major QTL associated with rice grain width and weight; Grain Width 2
                基因符號GW2; gw2.1
                所在染色體2 (已克隆)

                GW2(EF447275, Song et al. 2007; LOC_Os02g14720, Hao et al. 2021; Os02g0244100, Huang et al. 2022)...

                GW2位點,影響稻谷的粒寬和粒重,來源于WY3的等位基因顯著增加了谷粒的粒寬和粒重。

                【定位與克隆】

                FAZ1的GW2包含有8個外顯子,cDNA全長1634 bp,編碼由425氨基酸組成、47 kDa大小的蛋白產(chǎn)物,而WY3由于第4外顯子上一個堿基的缺失,引起GW2等位基因在轉(zhuǎn)錄過程中提前終止了翻譯,產(chǎn)物只保留有115氨基酸。

                【亞細胞定位】

                細胞質(zhì)(Song et al. 2007);細胞核和細胞膜(Huang et al. 2022)

                【生物學(xué)功能】

                GW2編碼一個E3泛素連接酶,位于細胞質(zhì)中,通過將其底物錨定到蛋白酶體進行降解,從而負調(diào)節(jié)細胞的分裂(Song et al. 2007)。

                GW2的WY3等位基因顯著地增加粒寬和千粒重,從而增加單株產(chǎn)量,該等位基因同時也能增加每株穗數(shù)、延長生育期,并顯著地降低每穗粒數(shù)和主穗長度,表明GW2具有明顯的一因多效。

                GW2功能的缺失將不能將泛素轉(zhuǎn)移到靶蛋白上,因而使得本應(yīng)降解的底物不能被特異識別,進而激活穎花外殼細胞的分裂,從而增加穎花外殼的寬度,另一方面,間接地,灌漿速率也得到了提高,胚乳的大小隨之也得到了增加,最終谷殼的寬度、粒重以及產(chǎn)量都得到了增加。

                谷氧還蛋白 WG1/OsGRX8調(diào)控水稻籽粒大小,是粒寬方向細胞增殖所必需。WG1也調(diào)控粒長方向細胞增殖,但不顯著。E3泛素連接酶GW2可以與WG1互作并將其泛素化,從而調(diào)控WG1蛋白的穩(wěn)定性。WG1能與轉(zhuǎn)錄因子OsbZIP47直接互作,并招募轉(zhuǎn)錄共抑制子ASP1來抑制OsbZIP47的轉(zhuǎn)錄活性,從而調(diào)控下游基因的表達(Hao et al. 2021)。

                gw2.1通過調(diào)節(jié)細胞增殖影響水稻穎殼形狀。相比野生型,近等基因系NIL-gw2.1的粒長和粒寬增加,導(dǎo)致千粒重和稻谷產(chǎn)量增加。有意思的,gw2.1還能降低堊白度(Huang et al. 2022)。

                GW2通過靶向并泛素化降解EXPLA1,負調(diào)節(jié)水稻種子大。–hoi et al. 2018)。

                【相關(guān)登錄號】
                contigs及其產(chǎn)物:AP005004BAD28268; AP014958BAS77855
                基因及產(chǎn)物ID號:KC609030AGP76213
                cDNAs及其產(chǎn)物:EF447275ABO31101, AK065504
                參考基因組位點:Os02g0244100(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os02g14720(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4328856(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015772191XP_015627677
                uniprot庫登錄號:B9F4Q9
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征抽穗期(TO:0000137), 種子大小(TO:0000391), 籽粒產(chǎn)量(TO:0000396), 穗數(shù)(TO:0000443), 單株穗數(shù)(TO:0000152), 每穗粒數(shù)(TO:0002759), 粒寬(TO:0000402), 堊白胚乳(TO:0000266), 千粒重(TO:0000592)
                分子功能泛素連接酶活性(GO:0061630)
                生物進程細胞分裂調(diào)控(GO:0051302), 蛋白泛素化(GO:0016567), 基因表達調(diào)控(GO:0010468), 有絲分裂調(diào)控(GO:0007346), 細胞增殖調(diào)控(GO:0042127), 種子發(fā)育調(diào)控(GO:0080050)
                細胞結(jié)構(gòu)cullin-RING類泛素連接酶復(fù)合物(GO:0031461)
                形態(tài)構(gòu)造灌漿結(jié)實期(GRO:0007141), 果實(PO:0009001)
                ·參考文獻
                1Jinpeng Huang;Zhiming Chen;Jiajia Lin;Binbin Guan;Jinwen Chen;Zesen Zhang;Fangyu Chen;Liangrong Jiang;Jingsheng Zheng;Tiansheng Wang;Huiqing Chen;Wangyou Xie;Senhao Huang;Houcong Wang;Yumin Huang;Rongyu Huang
                  gw2.1, a new allele of GW2, improves grain weight and grain yield in rice
                  Plant Science, 2022, 325: 111495
                2Jianqin Hao;Dekai Wang;Yingbao Wu;Ke Huang;Penggen Duan;Na Li;Ran Xu;Dali Zeng;Guojun Dong;Baolan Zhang;Limin Zhang;Dirk Inzé;Qian Qian;Yunhai Li
                  The GW2-WG1-OsbZIP47 pathway controls grain size and weight in rice
                  Molecular Plant, 2021, 14(8): 1266-1280
                3Beom Seok Choi;Yeon Jeong Kim;Kesavan Markkandan;Yeon Jong Koo;Jong Tae Song;Hak Soo Seo
                  GW2 Functions as an E3 Ubiquitin Ligase for Rice Expansin-Like 1
                  International Journal of Molecular Sciences, 2018, 19(7): 1904
                4Song Yan;Guihua Zou;Sujuan Li;Hua Wang;Heqin Liu;Guowei Zhai;Peng Guo;Hongmiao Song;Changjie Yan;Yuezhi Tao
                  Seed size is determined by the combinations of the genes controlling different seed characteristics in rice
                  Theoretical and Applied Genetics, 2011, 123(7): 1173-1181
                5Xian-Jun Song;Wei Huang;Min Shi;Mei-Zhen Zhu;Hong-Xuan Lin
                  A QTL for rice grain width and weight encodes a previously unknown RING-type E3 ubiquitin ligase
                  Nature Genetics, 2007, 39: 623-630
                中國水稻研究所
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