水稻xa5基因是具有重要研究和育種價值的隱性廣譜抗白葉枯病基因。利用水稻品系IR24及其近等基因系IRBB5(含xa5基因)雜交組合，構建了含4892個單株的F2定位群體。同時，利用與xa5連鎖的RFLP標記篩查含xa5基因的水稻抗性品系IRBB56的BAC文庫，構建了一個覆蓋目標基因位點的長約213kb的跨疊克隆群。根據國際水稻基因組和中國超級雜交稻基因組序列，以及跨疊克隆群的部分亞克隆測序，設計了一系列SSLP和CAPS標記對目標基因進行精細遺傳定位。xa5基因定位在2個CAPS標記K5和T4之間且與T2共分離，標記K5和T4之間的遺傳距離為0.3cM，物理距離約為24kb。對xa5基因所在的24kb片段DNA序列進行基因預測，揭示出可能編碼ABC轉運蛋白和轉錄因子TFIIA小亞基的2個基因。對這一區(qū)段及其編碼基因的功能研究將闡明xa5抗白葉枯病的分子機制。