·常規(guī)信息  最近更新：2021年2月13日 21:42:00
                基因(座)名稱白葉枯病抗性基因; 細(xì)菌性條斑病抗性基因; 轉(zhuǎn)錄因子ⅡAγ亞基
                Bacterial Blight resistance 5; Resistance to Bacterial Leaf Streak; transcription factor IIA gamma subunit 5
                基因符號(hào)xa5; OsTFIIAγ5; qBlsr5a
                所在染色體5 （已克�。�
                qBlsr5a(LOC_Os05g01710, Xie et al. 2014), xa5(AY643717/AF532975, Iyer et al. 2004), TFIIAγ5(Jiang et al. 2006), 位于同一基因位點(diǎn)...
                

                xa5是抗白葉枯病隱性基因，同時(shí)對(duì)細(xì)菌性條斑病可能也具有抗性。
                

                【定位與克隆】
                

                xa5位于5號(hào)染色體，cDNA全長(zhǎng)906bp，包含有3個(gè)外顯子，編碼一個(gè)由106氨基酸組成的蛋白產(chǎn)物，該蛋白產(chǎn)物是一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子ⅡA的γ亞基（TFⅡAγ）。與先前發(fā)現(xiàn)的抗病基因不同，TFⅡAγ是真核生物的轉(zhuǎn)錄因子，但其在抗病基因中的作用以前未知。xa5在抗病品種IRBB5和感病品種日本晴及IR24中有兩個(gè)堿基的差異，導(dǎo)致IRBB5中的第39位的纈氨酸在日本晴及IR24中變成谷氨酸。xa5的3'-UTR在IRBB5和IR24之間發(fā)生5bp的置換，但發(fā)生置換的這5bp在IRBB5和日本晴中是一樣的，說明這個(gè)差異并不引起抗病性的差異。
                

                xa5是一個(gè)隱性抗病基因，其基因結(jié)構(gòu)與其他典型的抗病基因的結(jié)構(gòu)都不一樣。xa5的序列在抗病和感病品種中有兩個(gè)堿基的差異導(dǎo)致一個(gè)氨基酸的改變（纈氨酸變成谷氨酸），該氨基酸位點(diǎn)位于蛋白三維結(jié)構(gòu)的表面，可能與蛋白的相互作用有關(guān)。該氨基酸位點(diǎn)的差異引起抗病性的差異在其他抗病和感病品種中也存在，說明xa5基因型與抗病表型的相關(guān)性是保守的。
                

                【生物學(xué)功能】
                

                白葉枯病菌在雜合和純合感病水稻上的生長(zhǎng)沒有顯著差別，一個(gè)Xa5 等位基因足以使抗病品種發(fā)病，增加一個(gè)拷貝并不能增加病斑的長(zhǎng)度。秈稻背景的抗病近等基因系比感病近等基因系的病原菌數(shù)目更多，但并沒表現(xiàn)出病斑，相反，粳稻背景的抗病和感病近等基因系的病原菌數(shù)目有很大差異，無論是秈稻和粳稻背景的抗病進(jìn)等基因系，病原菌的轉(zhuǎn)移都被延遲。這些結(jié)果表明xa5 介導(dǎo)的隱性抗病反應(yīng)抑制了病原菌的轉(zhuǎn)移而不是限制病原菌的增殖(Iyer-Pascuzzi et al., 2008)。
                

                水稻黃單胞菌兩個(gè)致病變種白葉枯病菌和條斑病菌的轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物(TALEs)，能直接與TFIIAγ5相互作用，激活宿主即水稻的易感基因，TFIIAγ5表達(dá)下調(diào)或或突變使得轉(zhuǎn)基因水稻具有抗病性（Yuan et al. 2016）。
                【相關(guān)登錄號(hào)】
                contigs及其產(chǎn)物：AP014961↘BAS91888
                基因及產(chǎn)物ID號(hào)：KF689653→AHC94886, KF689654→AHC94887
                cDNAs及其產(chǎn)物：AK065182→BAG89404, HQ324815→AEP20535, AY643716→AAV53715, AY643717→AAV53716, AK060845, BT129756, BT130053
                參考基因組位點(diǎn)：Os05g0107700（RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)）←→ LOC_Os05g01710（本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)）←→ LOC4337575（NCBI）
                參考基因組產(chǎn)物：XM_015785148→XP_015640634, XM_015785149→XP_015640635, XM_015785150→XP_015640636
                uniprot庫(kù)登錄號(hào)：Q0DLD3, B7EAK7
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                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征白葉枯病抗性(TO:0000175), 水稻細(xì)菌性條斑病抗性(TO:0000203)
                分子功能DNA轉(zhuǎn)錄因子活性(GO:0003700)
                生物進(jìn)程RNA聚合酶II啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的轉(zhuǎn)錄起始(GO:0006367), 基因表達(dá)調(diào)控(GO:0010468), 抗細(xì)菌反應(yīng)調(diào)控(GO:1900424)
                細(xì)胞結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄因子TFIIA復(fù)合物(GO:0005672)
                形態(tài)構(gòu)造維管葉(PO:0009025)
                ·參考文獻(xiàn)
                1. Meng Yuan;Yinggen Ke;Renyan Huang;Ling Ma;Zeyu Yang;Zhaohui Chu;Jinghua Xiao;Xianghua Li;Shiping Wang
                  A host basal transcription factor is a key component for infection of rice by TALE-carrying bacteria
                  eLife, 2016, 5: e19605
                2. Xiaofang Xie;Zhiwei Chen;Jinliang Cao;Huazhong Guan;Degong Lin;Chunlan Li;Tao Lan;Yuanlin Duan;Damei Mao;Weiren Wu
                  Toward the Positional Cloning of qBlsr5a, a QTL Underlying Resistance to Bacterial Leaf Streak, Using Overlapping Sub-CSSLs in Rice
                  PLoS ONE, 2014, 9(4): e95751
                3. KEYU GU;DONGSHENG TIAN;CHENGXIANG QIU;ZHONGCHAO YIN
                  Transcription activator-like type III effector AvrXa27 depends on OsTFIIAγ5 for the activation of Xa27 transcription in rice that triggers disease resistance to Xanthomonas oryzae pv. oryzae
                  Molecular Plant Pathology, 2009, 10(6): 829-835
                4. A. S. Iyer-Pascuzzi;H. Jiang;L. Huang;S. R. McCouch
                  Genetic and Functional Characterization of the Rice Bacterial Blight Disease Resistance Gene xa5
                  Phytopathology, 2008, 98(3): 289-295
                5. Anjali S. Iyer-Pascuzzi;Susan R. McCouch
                  Functional markers for xa5-mediated resistance in rice (Oryza sativa, L.)
                  Molecular Breeding, 2007, 19(4): 291-296
                6. Guang-Huai Jiang;Zhi-Hui Xia;Yong-Li Zhou;Jia Wan;Da-Yong Li;Run-Sheng Chen;Wen-Xue;Li-Huang Zhu
                  Testifying the rice bacterial blight resistance gene xa5 by genetic complementation and further analyzing xa5 ( Xa5 ) in comparison with its homolog TFIIAγ1
                  Molecular Genetics and Genomics, 2006, 275(4): 354-366
                7. Anjali S. Iyer;Susan R. McCouch
                  The Rice Bacterial Blight Resistance Gene xa5 Encodes a Novel Form of Disease Resistance
                  Molecular Plant-Microbe Interactions, 2004, 17(12): 1348-1354
                8. 鐘義明;江光懷;陳學(xué)偉;夏志輝;李曉兵;朱立煌;翟文學(xué)
                  水稻含隱性抗白葉枯病基因xa5的24kb片段的鑒定與基因預(yù)測(cè)
                  科學(xué)通報(bào), 2003, 48(19): 2057-2061
                9. Amanda J. Garris;Susan R. McCouch;Stephen Kresovich
                  Population Structure and Its Effect on Haplotype Diversity and Linkage Disequilibrium Surrounding the xa5 Locus of Rice (Oryza sativa L.)
                  Genetics, 2003, 165(2): 759-769
                10. Matthew W. Blair;Amanda J. Garris;Anjali S. Iyer;Brad Chapman;Stephen Kresovich;Susan R. McCouch
                  High resolution genetic mapping and candidate gene identification at the xa5 locus for bacterial blight resistance in rice (Oryza sativa L.)
                  Theoretical and Applied Genetics, 2003, 107(1): 62-73
                11. Marella Lalitha Shanti;M. L. C. George;C. M. Vera Cruz;M. A. Bernardo;R. J. Nelson;H. Leung;J. N. Reddy;R. Sridhar
                  Identification of Resistance Genes Effective Against Rice Bacterial Blight Pathogen in Eastern India
                  Phytopathology, 2001, 85(5): 506-512
                12. D. Yang;A. Sanchez;G. S. Khush;Y. Zhu;N. Huang
                  Construction of a BAC contig containing the xa5 locus in rice
                  Theoretical and Applied Genetics, 1998, 97(7): 1120-1124
                13. M. W. Blair;S. R. McCouch
                  Microsatellite and sequence-tagged site markers diagnostic for the rice bacterial leaf blight resistance gene xa-5
                  Theoretical and Applied Genetics, 1997, 95(1-2): 174-184
                14. V. Petpisit;Gurdev S. Khush;H. E. Kauffman
                  Inheritance of Resistance to Bacterial Blight in Rice
                  Crop Science, 1977, 17(4): 551-554
                中國(guó)水稻研究所
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