·常規(guī)信息  最近更新:2024年10月4日 19:10:00
                基因(座)名稱F-box蛋白; SCF E3泛素連接酶亞基
                auxin-responsive Kelch-domain-containing F-box protein; component of an SCF E3 ligase; ORYZA SATIVA F-BOX KELCH 1; functional orthologue of F-box protein HAWAIIAN SKIRT
                基因符號(hào)OsFBK1
                所在染色體1 (已克隆)

                OsFBK1(Os01g47050, Borah and Khurana 2018, Borah et al. 2023, Borna et al. 2022)...

                【突變體表型】

                相比日本晴,RNAi株系osfbk1RNAi在14、21和60 d時(shí)顯得矮小,25 d時(shí)根較短,60 d時(shí)分蘗數(shù)少,90 d后株高又比野生型更高,每穗總粒數(shù)和粒重降低;過(guò)表達(dá)植株OsFBK1OE在14和21 d時(shí)均矮小,但60和90 d時(shí)沒(méi)差異,穗長(zhǎng)、每穗總粒數(shù)和每穗實(shí)粒數(shù)降低,粒寬和粒重增加,穎殼(內(nèi)外稃)、雄蕊和心皮數(shù)量增加。osfbk1RNAiOsFBK1OE的籽粒均比野生型長(zhǎng)(Borna et al. 2022)。

                【定位與克隆】

                 

                【時(shí)空表達(dá)譜】

                相對(duì)于根,OsFBK1在水稻的葉、莖和穗中表達(dá)量更高,分別是根中的6、3和2倍,而在灌漿期的籽粒中表達(dá)量低于根。EP3OsFBK1組織中共表達(dá),但有些細(xì)胞只表達(dá)EP3OsFBK1中的一個(gè),而有些細(xì)胞則同時(shí)表達(dá)這兩個(gè)基因,說(shuō)明EP3OsFBK1可能在一些細(xì)胞中獨(dú)立作用,在另一些細(xì)胞中相互依賴(Borna et al. 2022)。

                【亞細(xì)胞定位】

                細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)(Borna et al. 2022)

                【生物學(xué)功能】

                EP3和OsFBK1會(huì)影響水稻株型、器官大小、花器官數(shù)量和大小、花形態(tài)、花粉活力、籽粒大小和重量等諸多性狀。EP3和OsFBK1可能拮抗調(diào)節(jié)籽粒大小和重量(Borna et al. 2022)。

                OsFBK1是SCF E3連接酶的組成部分。與野生型和敲低轉(zhuǎn)基因植株相比,過(guò)表達(dá)OsFBK1植株花藥中次生壁增厚(或木質(zhì)素)明顯降低,轉(zhuǎn)基因植株的根中也表現(xiàn)出木質(zhì)素的差異積累。熒光和免疫沉淀證實(shí)OsFBK1與OsCCR14的互作,SCFOsFBK1和26S蛋白酶體途徑介導(dǎo)OsCCR14降解,OsCCR敲除植株的根和花藥中木質(zhì)素沉積也減少(Borah and Khurana 2018)。

                花藥發(fā)育早期受生長(zhǎng)素調(diào)節(jié),OsCCR14在細(xì)胞質(zhì)中執(zhí)行其酶促過(guò)程;花藥成熟后期,OsATL53通過(guò)與OsCCR14形成復(fù)合物來(lái)減弱這種酶活性。OsATL53對(duì)OsCCR14酶活性的調(diào)節(jié)也可能控制其他組織如根的木質(zhì)化。成熟花藥和其它組織中茉莉酸(JA)濃度的增加,誘導(dǎo)了OsCCR14-OsATL53復(fù)合物的構(gòu)象變化,并促使其向核周邊移動(dòng)。復(fù)合物結(jié)構(gòu)的變化使其被SCFOsFBK1識(shí)別為底物,從而降解細(xì)胞質(zhì)中的OsATL53并釋放OsCCR14,而OsCCR14要么留在細(xì)胞質(zhì)中執(zhí)行木質(zhì)化功能,要么轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核中被SCFOsFBK1降解。剩余的OsATL53可能作為OsFBK1復(fù)合物進(jìn)入細(xì)胞核,在那里它也最終被降解。OsATL53也可能通過(guò)未知途徑調(diào)節(jié)OsCCR14的轉(zhuǎn)錄(Borah et al. 2023)。

                【相關(guān)登錄號(hào)】
                contigs及其產(chǎn)物:AP003291BAD72393; AP004364BAD72480; AP014957BAS73524
                cDNAs及其產(chǎn)物:AK121359
                參考基因組位點(diǎn):Os01g0659900(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os01g47050(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4327169(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015774638XP_015630124
                uniprot庫(kù)登錄號(hào):Q5SMS6
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征根發(fā)育性狀(TO:0000656), 株高(TO:0000207), 花粉育性(TO:0000421), 根長(zhǎng)度(TO:0000227), 穗長(zhǎng)(TO:0000040), 分蘗數(shù)(TO:0000346), 種子大小(TO:0000391), 小花形態(tài)解剖學(xué)性狀(TO:0000274), 每穗實(shí)粒數(shù)(TO:0000447), 粒長(zhǎng)(TO:0000734), 花器官數(shù)量(TO:0006038), 外稃數(shù)目(TO:0000208), 內(nèi)稃數(shù)目(TO:0000209), 雄蕊數(shù)目(TO:0000225), 心皮數(shù)目(TO:0006013), 花器官發(fā)育特征(TO:0006022), 木質(zhì)素含量(TO:0000731), 花藥長(zhǎng)度(TO:0000531), 千粒脫殼谷粒重(TO:0000592), 生長(zhǎng)素敏感性(TO:0000163), 單株產(chǎn)量(TO:0000449), 花器官大小(TO:0002600), 穎片數(shù)(TO:0006029), 生長(zhǎng)遲緩(TO:0001357)
                分子功能蛋白結(jié)合(GO:0005515)
                生物進(jìn)程穗發(fā)育(GO:0010229), 花粉發(fā)育(GO:0009555), 花器官數(shù)確定(GO:0048833), 花器官發(fā)育(GO:0048437), 花藥發(fā)育(GO:0048653), 泛素和SCF依賴的蛋白酶體蛋白分解代謝過(guò)程(GO:0031146), 分蘗形成調(diào)控(GO:2000032), 種子發(fā)育調(diào)控(GO:0080050), 根發(fā)育調(diào)控(GO:2000280), 木質(zhì)素生物合成調(diào)控(GO:1901141), 次生細(xì)胞壁形成調(diào)控(GO:2000652)
                細(xì)胞結(jié)構(gòu)SCF泛素連接酶復(fù)合物(GO:0019005)
                ·參考文獻(xiàn)
                1Pratikshya Borah;Aishwarye Sharma;Arun Kumar Sharma;Paramjit Khurana;Jitendra Paul Khurana
                  SCFOsFBK1 E3 ligase mediates jasmonic acid-induced turnover of OsATL53 and OsCCR14 to regulate lignification of rice anthers and roots
                  Journal of Experimental Botany, 2023, 74(19): 6188-6204
                2Rita S. Borna;Erik H. Murchie;Kevin A. Pyke;Jeremy A. Roberts;Zinnia H. Gonzalez-Carranza
                  The rice EP3 and OsFBK1 E3 ligases alter plant architecture and flower development, and affect transcript accumulation of microRNA pathway genes and their targets
                  Plant Biotechnology Journal, 2022, 20(2): 297-309
                3Pratikshya Borah;Jitendra P. Khurana
                  The OsFBK1 E3 Ligase Subunit Affects Anther and Root Secondary Cell Wall Thickenings by Mediating Turnover of a Cinnamoyl-CoA Reductase
                  Plant Physiology, 2018, 176(3): 2148-2165
                中國(guó)水稻研究所
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