·常規(guī)信息  最近更新:2024年7月5日 5:37:00
                基因(座)名稱分蘗角度增加調(diào)控子; CCCH型鋅指蛋白
                TILLER ANGLE INCREASED CONTROLLER; CCCH-Type Zinc Finger Protein
                基因符號(hào)OsLIC1
                所在染色體6 (已克。

                OsLIC1(AK107008, Wang et al. 2008; LOC_Os06g49080, Wang et al. 2022)...

                OsLIC1是一個(gè)CCCH型鋅指蛋白,是一個(gè)具有轉(zhuǎn)錄激活活性的轉(zhuǎn)錄因子。

                【突變體表型】

                抑制內(nèi)源OsLIC表達(dá),會(huì)導(dǎo)致葉夾角和分蘗角度明顯增加,株高縮短,并因而減少籽粒產(chǎn)量(Wang et al. 2008)。

                【時(shí)空表達(dá)譜】

                OsLIC主要在水稻葉枕和分蘗芽中表達(dá),其表達(dá)受油菜素內(nèi)酯(BR)調(diào)控(Wang et al. 2008)。

                【亞細(xì)胞定位】

                細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)(Wang et al. 2008)

                【生物學(xué)功能】

                OsLIC蛋白具有一個(gè)CCCH基序,表現(xiàn)出對(duì)雙鏈DNA、單鏈polyrA、單鏈polyrU和單鏈polyrG的結(jié)合活力,但不能結(jié)合polyrC,作為一個(gè)轉(zhuǎn)錄激活子可能通過(guò)激活BR信號(hào)來(lái)調(diào)控水稻株型(Wang et al. 2008)。

                OsLIC1是一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,也具有RNA結(jié)合活性,是油菜素內(nèi)酯響應(yīng)途徑的負(fù)調(diào)節(jié)因子,通過(guò)BR信號(hào)通路調(diào)控水稻葉夾角大小、株高以及分蘗角度和穗粒數(shù)等株型特性,在水稻株型育種中具有重要意義(Wang et al. 2008)。

                OsLIC1是OsBZR1的一個(gè)直接靶標(biāo),能被GSK3激酶磷酸化,作為一個(gè)與BZR1拮抗的鋅指轉(zhuǎn)錄因子,減弱BR信號(hào)(Zhang et al. 2012)。

                OsALDH2B1和OsBZR1功能拮抗,它們可能形成復(fù)合物,相互抑制對(duì)方的DNA結(jié)合活性。OsALDH2B1AOS2是OsBZR1的直接靶標(biāo),OsBZR1能抑制OsALDH2B1AOS2的表達(dá);OsALDH2B1和OsLIC也能抑制AOS2表達(dá)?傊,OsALDH2B1和OsLIC可能通過(guò)激活茉莉酸的合成和信號(hào)傳導(dǎo),提高水稻的防衛(wèi)反應(yīng),或者,油菜素內(nèi)酯通過(guò)茉莉酸途徑調(diào)控水稻防衛(wèi)水平(右圖, Ke et al. 2019)。

                OsLIC作為OsMAPK6的底物,通過(guò)直接抑制OsWRKY30轉(zhuǎn)錄,負(fù)調(diào)控水稻對(duì)白葉枯病菌(Xoo)和細(xì)菌性條斑病菌(Xoc)的抗性。生化分析發(fā)現(xiàn)OsLIC能與OsWRKY30啟動(dòng)子結(jié)合并抑制其轉(zhuǎn)錄。遺傳分析證實(shí)敲除突變體oslicOsWRKY30過(guò)表達(dá)系對(duì)XooXoc表現(xiàn)出抗性增強(qiáng),在oslic中敲除OsWRKY30減弱了對(duì)細(xì)菌病原體的抗性。OsMAPK6與OsLIC物理互作并磷酸化OsLIC,導(dǎo)致OsLIC對(duì)OsWRKY30啟動(dòng)子的DNA結(jié)合活性降低,從而促進(jìn)了OsWRKY30的轉(zhuǎn)錄,因此,過(guò)表達(dá)OsLIC部分抑制了OsMAPK6介導(dǎo)的抗性(Wang et al. 2022)。

                LIC是油菜素甾醇(BR)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的負(fù)調(diào)控因子,受BR誘導(dǎo)。LIC能直接抑制OsSHI1表達(dá),調(diào)節(jié)其BR響應(yīng)。OsSHI1表達(dá)水平在lic-1功能獲得突變體中下降(Duan et al. 2023)。

                【相關(guān)登錄號(hào)】
                contigs及其產(chǎn)物:AP014962BAS99381; AP004324BAD54049
                cDNAs及其產(chǎn)物:AK107008
                參考基因組位點(diǎn):Os06g0704300(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os06g49080(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4341994(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015785913XP_015641399
                uniprot庫(kù)登錄號(hào):Q5Z807
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征稻瘟病抗性(TO:0000074), 白葉枯病抗性(TO:0000175), 水稻細(xì)菌性條斑病抗性(TO:0000203), 株高(TO:0000207), 谷物產(chǎn)量(TO:0000396), 分蘗角度(TO:0000567), 油菜素甾醇敏感性(TO:0002677), 每穗粒數(shù)(TO:0002759), 葉傾角(TO:0002688)
                分子功能DNA轉(zhuǎn)錄因子活性(GO:0003700)
                生物進(jìn)程基因表達(dá)調(diào)控(GO:0010468), 茉莉酸信號(hào)通路調(diào)控(GO:2000022), 油菜素甾醇信號(hào)通路調(diào)控(GO:1900457), 茉莉酸生物合成調(diào)控(GO:0080141), 葉發(fā)育調(diào)控(GO:2000024), 抗細(xì)菌先天免疫反應(yīng)(GO:0140367), 抗真菌先天免疫反應(yīng)調(diào)控(GO:1905034)
                ·參考文獻(xiàn)
                1Erchao Duan;Qibing Lin;Yihua Wang;Yulong Ren;Huan Xu;Yuanyan Zhang;Yunlong Wang;Xuan Teng;Hui Dong;Yupeng Wang;Xiaokang Jiang;Xiaoli Chen;Jie Lei;Hang Yang;Rongbo Chen;Ling Jiang;Haiyang Wang;Jianmin Wan
                  The transcriptional hub SHORT INTERNODES1 integrates hormone signals to orchestrate rice growth and development
                  The Plant Cell, 2023, 35(8): 2871-2886
                2Lihan Wang;Jie Chen;Yuqin Zhao;Shiping Wang;Meng Yuan
                  OsMAPK6 phosphorylates a zinc finger protein OsLIC to promote downstream OsWRKY30 for rice resistance to bacterial blight and leaf streak
                  Journal of Integrative Plant Biology, 2022, 64(5): 1116-1130
                3Chen-li Zhu;Bao Xing;Shou-zhen Teng;Chen Deng;Zhen-yong Shen;Peng-fei Ai;Tie-gang Lu;Sheng-wei Zhang;Zhi-guo Zhang
                  OsRELA Regulates Leaf Inclination by Repressing the Transcriptional Activity of OsLIC in Rice
                  Frontiers in Plant Science, 2021, 12: 760041
                4Cui Zhang;Yunyuan Xu;Siyi Guo;Jiaying Zhu;Qing Huan;Huanhuan Liu;Lei Wang;Guanzheng Luo;Xiujie Wang;Kang Chong
                  Dynamics of Brassinosteroid Response Modulated by Negative Regulator LIC in Rice
                  PLoS Genetics, 2012, 8(4): e1002686
                5Lei Wang;Yunyuan Xu;Cui Zhang;Qibin Ma;Se-Hwan Joo;Seong-Ki Kim;Zhihong Xu;Kang Chong
                  OsLIC, a Novel CCCH-Type Zinc Finger Protein with Transcription Activation, Mediates Rice Architecture via Brassinosteroids Signaling
                  PLoS ONE, 2008, 3(10): e3521
                中國(guó)水稻研究所
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