semidwarf and high-tillering; microRNA
SDT/OsmiR156h(LOC_Os06g44034, Zhao et al. 2015; MI0000662, Miao et al. 2019)...
SDT編碼OsmiR156h microRNA的前體。Zhao et al. 2015一文中的OsmiR156h，對(duì)應(yīng)miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)的osa-miR156j-5p。
【定位與克隆】
依據(jù)序列和功能差異，miR156分為兩個(gè)亞族：II類(lèi)包括miR156a/b/c/k/l，突變會(huì)顯著增強(qiáng)種子休眠，抑制穗發(fā)芽，對(duì)株型和產(chǎn)量影響微不足道；I類(lèi)包括miR156d/e/f/g/h/i，缺失會(huì)抑制無(wú)效分蘗、增加株高、增強(qiáng)莖稈抗倒能力、增加粒長(zhǎng)和粒重，表現(xiàn)為理想株型形態(tài)，對(duì)種子休眠無(wú)顯著影響（Miao et al. 2019）。
圖位克隆表明，sdt中LOC_Os06g44034第2外顯子有131 bp的替換，SDT編碼OsmiR156h microRNA的前體（Zhao et al. 2015）。
---- uc cau aaggc u - - a c c u c g 5' uuggggcggg gcggga gag auga gagau guugacagaa gag agugagcac cggcg gg ggc ag cauc g |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| || |||| c 3' agccccgccc cgcccu cuc uacu cucua cgacugucuu cuc ucgcucgug gccgc cc ccg uc guag g ccua cc -ac ----- - u c c - - - c g
基因組位置(MSU7)：Chr6: 26554795-26554959 [+]
成熟osa-miR156j-5p的序列(5'→3')：42 - ugacagaagagagugagcac - 61
成熟osa-miR156j-3p的序列(5'→3')：108 - gcucgcuccucuuucugucagc - 129
【突變體表型】
突變體mir156abcdfghikl、mir156defghi和mir156abckl幼苗不定根數(shù)顯著少于野生型，表明I類(lèi)和II類(lèi)miR156對(duì)水稻不定根形成都起作用（Miao et al. 2019）。
sdt自然等位變異會(huì)影響株高和分蘗，sdt植株表現(xiàn)出株高變矮、抗倒伏性增強(qiáng)、分蘗數(shù)增加以及產(chǎn)量提高等表型（Zhao et al. 2015）。
【時(shí)空表達(dá)譜】
【亞細(xì)胞定位】
【生物學(xué)功能】
miR-156–IPA1是水稻生長(zhǎng)和防衛(wèi)之間的新調(diào)節(jié)因子（Liu et al. 2019）
OsmiR156h的多聚腺苷酸化狀態(tài)會(huì)引起sdt的表型。sdt等位基因和OsSPL14WFP等位基因聚合，能同時(shí)有效提高分蘗能力以及穗部分枝，因而提高收獲指數(shù)和稻谷產(chǎn)量。最重要的是，在雜交水稻育種中，將sdt等位基因和綠色革命基因sd1聚合，能夠提高稻谷產(chǎn)量約20%（Zhao et al. 2015）。
OsmiR156h能調(diào)控OsSPL14，進(jìn)而影響水稻的株型，如分蘗和穗分枝等（Zhao et al. 2015）。
Osmir156能作用于OsSPL3和OsSPL12的轉(zhuǎn)錄本，使其降解，參與調(diào)控冠狀根發(fā)育，其在細(xì)胞中的積累水平受CRD1調(diào)控。OsSPL3或OsSPL12能與下游靶基因OsMADS50的啟動(dòng)子區(qū)結(jié)合，調(diào)控其表達(dá)。因此，“CRD1-miR156-OsSPL3/OsSPL12-OsMADS50”可能組成一個(gè)模塊，通過(guò)調(diào)控生長(zhǎng)素轉(zhuǎn)運(yùn)(如OsPIN2, OsPIN5a, OsPIN5c)和信號(hào)傳導(dǎo)(如OsIAA5, OsARF13, OsARF19)，參與調(diào)控水稻不定根發(fā)生（Zhu et al. 2019; Shao et al. 2019）。
【相關(guān)登錄號(hào)】
| 參考基因組位點(diǎn)： | Os06g0649600（RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)）←→ LOC_Os06g44034（本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)） |
| miRBase庫(kù)登錄號(hào)： | osa-MIR156j(MI0000662) |