·常規(guī)信息  最近更新:2024年7月12日 4:34:00
                基因(座)名稱溫敏雄性核不育基因; RNA酶; 核糖核酸酶Z; 光溫敏雄性核不育基因
                thermosensitive male sterility-5; RNase; nuclear ribonuclease Z; photoperiod-thermo-sensitive genic male sterile gene
                基因符號tms5; ZS1; ptgms2-1; tms5-2; OsaTRZ1
                所在染色體2 (已克隆)

                tms5-2(Os02g0214300, Wen et al. 2019)...

                溫敏雄性不育基因tms5,控制安農(nóng)S-1、秈S和N28S等多個核不育系的高溫敏感性雄性不育。TMS5編碼一個保守的RNA酶ZS1。

                【基因的發(fā)現(xiàn)、命名與定位】

                中科院遺傳所利用安農(nóng)S-1×南京11 雜交產(chǎn)生的重組自交系F8 代群體,對安農(nóng)S-1 的不育基因進行了定位分析,將其溫敏不育基因定位于第2 染色體,位于標記C365 和G227 之間,并將該基因命名為tms5(Wang et al., 2003);進一步地,華南農(nóng)業(yè)大學發(fā)現(xiàn)了與tms5 基因完全共分離的EST 標記HN57,該標記位于第2染色體的31.2cM 處,并用SSR 標記和516 株F2 不育株將其定位在RMAN7 和RMAN54 之間的181kb 區(qū)域(Jiang et al., 2006)。

                利用3個不同的群體,tms5被精細定位于BAC克隆AP004039上4039-1 和4039-2之間的19kb范圍內(nèi),在此區(qū)間,轉(zhuǎn)錄因子基因ONAC023是可能的候選基因(Yang et al., 2007)。但等位分析表明,控制7 種溫敏型雄性不育材料(秈S,安農(nóng)S-1,Q523S,Q52S,N28S,G421S和Q527S)的基因均是tms5,定位于2號染色體的RMA81與RMX21兩標記間的183kb區(qū)間內(nèi),然而測序發(fā)現(xiàn),與野生型秈黃占相比,秈S和和安農(nóng)S-1在OSNAC6及其啟動子區(qū)域沒有任何突變位點,因此tms5的真實基因有待于進一步研究(Peng et al., 2010)。

                【亞細胞定位】

                細胞質(zhì)  

                【生物學功能】

                RNA酶ZS1能夠在體外和體內(nèi)把3個泛素核糖體L40融合蛋白基因(UbL40) mRNA加工成多個片段。高溫使得UbL40 mRNA水平上升,在tms5突變體中,由于ZS1功能缺失,UbL40 mRNA過度積累,導致花粉形成缺陷和雄性不育,而野生型中過量的UbL40 mRNA能被ZS1裂解,育性正常(Zhou et al. 2014)。

                【備注】

                Peng等的文獻中,OsNAC6 即Yang等文獻中的ONAC023,而與第1染色體的轉(zhuǎn)錄因子基因OsNAC6 不是同一個基因。

                【突變體表型】

                不育單株表現(xiàn)為花藥細小空癟,鏡檢表現(xiàn)為無花粉型(Xu et al. 2011)。

                【定位與克隆】

                利用F2群體的91個不育單株,將ptgms2-1定位在2號染色體上SSR標記RM12521和RM12823之間,遺傳距離分別為17和10.4cM,在此區(qū)間進一步發(fā)展45個InDel標記,利用634個來源于F2和BC1F2的不育單株,將目的基因基因定位在BAC AP004039一個50.4kb的區(qū)間內(nèi),位于InDel標記S2-40和S2-44之間,遺傳距離分別為0.08和0.16 cM,與標記S2-43共分離。候選基因分析,基因預測該區(qū)間內(nèi)有10個基因,確定一個核糖核酸酶Z基因為候選基因(Xu et al. 2011)。

                對廣占63S/旱1587組合的F2分離群體進行不育基因的遺傳分析,結(jié)果表明廣占63S的不育性受1對隱性不育基因控制。利用SSR和InDel分子標記技術(shù),結(jié)合BSA法,以廣占63S與旱1587組合的F2分離群體為材料,將不育基因(暫命名為PTGMS2-1)定位于第2染色體標記S2-4與S2-27之間物理距離390kb的區(qū)間內(nèi),與兩標記間的遺傳距離分別為0.5和1.1cM,與標記S2-24共分離(王寶和等, 2010)。

                【時空表達譜】

                利用RT-PCR,分析了候選基因(LOC_Os02g12290)在廣占63S和1587中的表達。在1587的根、莖、葉和穗中都正常表達,在廣占63S的根中正常表達,其他部位表達量顯著下調(diào)(Xu et al. 2011)。

                【生物學功能】

                ptgms2-1控制水稻的光溫敏雄性核不育性(Xu et al. 2011)。

                【相關(guān)登錄號】
                contigs及其產(chǎn)物:AP004039BAD25038; AP014958BAS77620
                參考基因組位點:Os02g0214300(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務←→ LOC_Os02g12290(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務←→ LOC4328713(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015770252XP_015625738
                uniprot庫登錄號:A0A0P0VGC7, A2X2E2, A3A4I3, Q6H8B1
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征花粉敗育(TO:0000053), 溫敏雄性核不育(TO:0000067), 光溫敏雄性核不育(TO:0000217)
                分子功能核糖核酸酶活性(GO:0004540)
                生物進程mRNA降解(GO:0006402)
                ·參考文獻
                1Hirendra Nath Barman;Zhonghua Sheng;Sajid Fiaz;Min Zhong;Yawen Wu;Yicong Cai;Wei Wang;Guiai Jiao;Shaoqing Tang;Xiangjin Wei;Peisong Hu
                  Generation of a new thermo-sensitive genic male sterile rice line by targeted mutagenesis of TMS5 gene through CRISPR/Cas9 system
                  BMC Plant Biology, 2019, 19: 109
                2Jianyu Wen;Liuting Wang;Jie Wang;Yafei Zeng;Yanghong Xu;Shaoqing Li
                  The transcription factor OsbHLH138 regulates thermosensitive genic male sterility in rice via activation of TMS5
                  Theoretical and Applied Genetics, 2019, 132: 1721-1732
                3Hai Zhou;Ming He;Jing Li;Liang Chen;Zhifeng Huang;Shaoyan Zheng;Liya Zhu;Erdong Ni;Dagang Jiang;Bingran Zhao;Chuxiong Zhuang
                  Development of Commercial Thermo-sensitive Genic Male Sterile Rice Accelerates Hybrid Rice Breeding Using the CRISPR/Cas9-mediated TMS5 Editing System
                  Scientific Reports, 2016, 6: 37395
                4Hai Zhou;Ming Zhou;Yuanzhu Yang;Jing Li;Liya Zhu;Dagang Jiang;Jingfang Dong;Qinjian Liu;Lianfeng Gu;Lingyan Zhou;Mingji Feng;Peng Qin;Xiaochun Hu;Chengli Song;Jinfeng Shi;Xianwei Song;Erdong Ni;Xiaojin Wu;Qiyun Deng;Zhenlan Liu;Mingsheng Chen;Yao-Guang Liu;Xiaofeng Cao;Chuxiong Zhuang
                  RNase ZS1 processes UbL40 mRNAs and controls thermosensitive genic male sterility in rice
                  Nature Communications, 2014, 5: 4884
                5Jianjun Xu;Baohe Wang;Yinhui Wu;Peina Du;Jun Wang;Man Wang;Chuandeng Yi;Minghong Gu;Guohua Liang
                  Fine mapping and candidate gene analysis of ptgms2-1, the photoperiod-thermo-sensitive genic male sterile gene in rice (Oryza sativa L.)
                  Theoretical and Applied Genetics, 2011, 122(2): 365-372
                6Lijuan Fan;Zhikang Wang;Jinyu Liu;Weili Guo;Jie Yan;Ying Huang
                  A survey of green plant tRNA 3'-end processing enzyme tRNase Zs, homologs of the candidate prostate cancer susceptibility protein ELAC2
                  BMC Evolutionary Biology, 2011, 11: 219
                7王寶和;徐建軍;吳銀慧;朱金燕;李生強;周勇;程小濤;梁國華
                  水稻光溫敏雄性核不育系廣占63S不育基因PTGMS2-1的遺傳分析與分子定位
                  中國水稻科學, 2010, 24(4): 429-432
                8H. F. Peng;X. H. Chen;Y. P. Lu;Y. F. Peng;B. H. Wan;N. D. Chen;B. Wu;S. P. Xin;G. Q. Zhang
                  Fine mapping of a gene for non-pollen type thermosensitive genic male sterility in rice (Oryza sativa L.)
                  Theoretical and Applied Genetics, 2010, 120(5): 1013-1020
                9Qingkai Yang;Chunyang Liang;Wen Zhuang;Jun Li;Huabing Deng;Qiyun Deng;Bin Wang
                  Characterization and identification of the candidate gene of rice thermo-sensitive genic male sterile gene tms5 by mapping
                  Planta, 2007, 225(2): 321-330
                10JIANG Dagang;LU Sen;ZHOU Hai;WU Xiaojin;ZHUANG Chuxiong;LIU Yaoguang;MEI Mantong
                  Mapping of the rice (Oryza sativa L.) thermo-sensitive genic male sterile gene tms5 with EST and SSR markers
                  Chinese Science Bulletin, 2006, 51(4): 417-420
                11姜大剛;盧森;周海;武小金;莊楚雄;劉耀光;梅曼彤
                  用EST和SSR標記定位水稻溫敏不育基因tms5
                  科學通報, 2006, 51(2): 148-151
                12Y. G. Wang;Q. H. Xing;Q. Y. Deng;F. S. Liang;L. P. Yuan;M. L. Weng;B. Wang
                  Fine mapping of the rice thermo-sensitive genic male-sterile gene tms5
                  Theoretical and Applied Genetics, 2003, 107(5): 917-921
                中國水稻研究所
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