| ·常規(guī)信息 最近更新：2023年12月11日 6:01:00 | |||||||||||
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| 基因(座)名稱 | 直立型密穗基因;小圓粒種基因 dense and erect panicle2 | ||||||||||
| 基因符號 | DEP2; EP2; SRS1; OsRELA | ||||||||||
| 所在染色體 | 7 （已克隆） | ||||||||||
srs1(Abe et al. 2010), DEP2(Li et al. 2010), EP2(Zhu et al. 2010), OsRELA(Os07g0616000, Zhu et al. 2021), 位于同一個基因位點... 【突變體表型】
【定位與克隆】DEP2含有10個外顯子，編碼一個由1365氨基酸組成的蛋白產物。測序發(fā)現dep2-1的第6外顯子有31個堿基的缺失，dep2-2的第2內含子有一個G/A 的顛換。31個堿基的缺失導致編碼框移動，而G/A的顛換改變了第2內含子的編輯位置，進而移碼（Li et al. 2010）。 【生物學功能】OsRELA是個轉錄調控因子。生化和遺傳分析表明OsRELA通過其保守的C端結構域與BR信號負調控因子OsLIC互作，抑制OsLIC的轉錄活性，從而調控水稻葉片夾角。切片觀察發(fā)現OsRELA促進莖細胞和葉枕近軸側薄壁細胞伸長，并抑制葉枕遠軸側厚壁組織細胞的分裂和擴張，正調控葉夾角和株高。突變體rela，葉片夾角變小、半矮化，穗長和葉長降低（Zhu et al. 2021）。 SRS1/DEP2調控水稻穗型和種子大小，主要在幼嫩組織如幼穗中表達。相比野生型，突變體srs1/dep2莖稈粗壯有更多維管束，穗直立、粒小而圓，千粒重略下降，但一二次枝梗數和每穗粒數無顯著變化（Abe et al. 2010; Li et al. 2010; Zhu et al. 2010）。 【亞細胞定位】細胞核（Zhu et al. 2021）；內質網（Zhu et al. 2010） 【相關登錄號】
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| ·ONTOLOGY及相關基因 | |
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| 表型特征 | 株高(TO:0000207), 穗長(TO:0000040), 葉長(TO:0000135), 種子大小(TO:0000391), 葉角(TO:0000206), 粒寬(TO:0000402), 粒長(TO:0000734), 維管束數目(TO:0000472), 莖粗(TO:0000339), 千粒重(TO:0000592), 植物細胞長度(TO:0020107), 穗密度(TO:0020001) |
| 分子功能 | 轉錄調控因子活性(GO:0140110), 轉錄因子結合(GO:0008134) |
| 生物進程 | 穗發(fā)育(GO:0010229), 細胞分裂調控(GO:0051302), 有絲分裂調控(GO:0007346), 油菜素甾醇信號通路調控(GO:1900457), 細胞增殖調控(GO:0042127), 種子發(fā)育調控(GO:0080050), 細胞伸長調控(GO:0051510), 細胞生長調控(GO:0001558), 葉發(fā)育調控(GO:2000024) |
| 細胞結構 | 內質網(GO:0005783) |
| ·參考文獻 |
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| 1. Chen-li Zhu;Bao Xing;Shou-zhen Teng;Chen Deng;Zhen-yong Shen;Peng-fei Ai;Tie-gang Lu;Sheng-wei Zhang;Zhi-guo Zhang OsRELA Regulates Leaf Inclination by Repressing the Transcriptional Activity of OsLIC in Rice Frontiers in Plant Science, 2021, 12: 760041 |
| 2. Yuki Abe;Keiko Mieda;Tsuyu Ando;Izumi Kono;Masahiro Yano;Hidemi Kitano;Yukimoto Iwasaki The SMALL AND ROUND SEED1 (SRS1/DEP2) gene is involved in the regulation of seed size in rice Genes & Genetic Systems, 2010, 85(5): 327-339 |
| 3. Feng Li;Wenbo Liu;Jiuyou Tang;Jinfeng Chen;Hongning Tong;Bin Hu;Chunlai Li;Jun Fang;Mingsheng Chen;Chengcai Chu Rice DENSE AND ERECT PANICLE 2 is essential for determining panicle outgrowth and elongation Cell Research, 2010, 20(7): 838-849 |
| 4. Keming Zhu;Ding Tang;Changjie Yan;Zhengchang Chi;Hengxiu Yu;Jianmin Chen;Jiansheng Liang;Minghong Gu;Zhukuan Cheng ERECT PANICLE2 Encodes a Novel Protein That Regulates Panicle Erectness in Indica Rice Genetics, 2010, 184(2): 343-350 |
| 5. S. TANABE;K. MIEDA;M. ASHIKARI;H. KITANO and Y. IWASAKI Mapping of Small and Round Seed 1 gene in rice Rice Genetics Newsletters, 2007, 23: 44-47 |
| 中國水稻研究所 |
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