利用基因組文庫加速Xa23基因定位的染色體步移

                王春連, 陳樂天, 曾超珍, 張群宇, 劉丕慶, 劉耀光, 樊穎倫, 章琦
                中國水稻科學(xué), 2006, 20(4): 355-360     追溯原文......本站官方QQ群:62473826
                水稻白葉枯病; 抗性基因; 基因定位; TAC文庫; PAC文庫; 染色體步移

                用距離水稻抗白葉枯病基因Xa23 0.8 cM的EST標(biāo)記C189,擴(kuò)增Xa23的近等基因系CBB23的基因組片段(0.8 kb)為探針,篩選水稻明恢63的TAC文庫和廣陸矮4號的PAC文庫,對獲得的7個陽性克隆用酶切法和TailPCR法進(jìn)行末端片段分離,獲得15個末端片段, 用于感病親本金剛30和抗病親本CBB23之間的多態(tài)性檢測,發(fā)現(xiàn)7個末端片段在雙親間有多態(tài)性,分別為69B、70N、81N、45B、45N、84N和84B。用這些末端片段作RFLP標(biāo)記,對金剛30/CBB23的F2群體進(jìn)行檢測和連鎖分析,結(jié)果表明這些標(biāo)記與Xa23的遺傳距離依次為0.4、0.4、0.4、0.5、0.6、0.6和1.1 cM。雖然69B、70N和81N與Xa23的遺傳距離均為0.4 cM,但序列比對揭示69B與70N的物理距離為35 kb,與81N為95 kb,69B距Xa23最近。三者與Xa23的遺傳距離雖然相同,但物理距離存在很大差異。這些末端片段標(biāo)記加密了Xa23基因一側(cè)的遺傳圖譜,并使其遺傳距離縮短到0.4 cM,加速了Xa23的定位進(jìn)程,為Xa23的分離克隆奠定了重要基礎(chǔ)。討論了這種染色體步移方法的適用條件。


                基因列表
                  白葉枯病抗性基因 Xa23
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