·常規(guī)信息 最近更新:2022年5月24日 16:49:00 | |||||||||
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基因(座)名稱 | 水稻低溫發(fā)芽勢(shì)主效控制基因 major QTL controlling low-temperature germinability in rice | ||||||||
基因符號(hào) | qLTG3-1 | ||||||||
所在染色體 | 3 (已克。 | ||||||||
qLTG3-1,控制水稻發(fā)芽期的低溫耐受性。 【表型特征】
目標(biāo)片段來(lái)自Italica Livorno、遺傳背景為Hayamasari 的近等基因系,低溫發(fā)芽勢(shì)比Hayamasari 高,而在正條件下發(fā)芽勢(shì)并沒(méi)有差別。此外,在300 mM NaCl 的鹽脅迫、500 mM 甘露醇的滲透脅迫以及30-42°C 的高溫脅迫下,近等基因系的發(fā)芽勢(shì)也比Hayamasari 高。 【基因克隆與生物學(xué)功能分析】qLTG3-1 位于3號(hào)染色體,包含1 個(gè)外顯子,編碼一個(gè)由184 氨基酸組成的蛋白產(chǎn)物,產(chǎn)物包含GRP 結(jié)構(gòu)域和LTP 結(jié)構(gòu)域。Hayamasari 品種中的qLTG3-1 基因發(fā)生71bp 片段的缺失,造成移碼突變。 qLTG3-1 編碼一個(gè)功能未知的蛋白,定位在胞質(zhì)和細(xì)胞核中。qLTG3-1 在胚、穗部和地上部表達(dá),在正常條件下和低溫下,qLTG3-1 在發(fā)芽后一天的胚中表達(dá),說(shuō)明其表達(dá)不受低溫誘導(dǎo);qLTG3-1 啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)GUS 報(bào)告基因表達(dá)分析表明,在浸種后一天qLTG3-1 只在覆蓋胚的組織中表達(dá),包括種皮的糊粉層和覆蓋胚芽鞘的上胚層表達(dá);組織切片分析表明在低溫發(fā)芽勢(shì)高的近等基因系中,胚組織的細(xì)胞比Hayamasari 品種的胚組織細(xì)胞更加松弛,液泡化程度更高;因此,在種子發(fā)芽過(guò)程中,qLTG3-1 特異的在種皮的糊粉層和覆蓋胚芽鞘的上胚層表達(dá),可能通過(guò)調(diào)節(jié)這些組織的細(xì)胞液泡化,從而引起這些組織的松弛而提高種子在低溫下的發(fā)芽勢(shì)。 【相關(guān)登錄號(hào)】
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·遺傳(物理)圖譜 | ||||
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# | 圖譜名稱 | 連鎖群 | 開(kāi)始位置 | 終止位置 |
1 | 日本晴序列注釋圖譜(2008) | 3 | 219067 | 219621 |
·ONTOLOGY及相關(guān)基因 | |
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表型特征 | 耐寒性(TO:0000303) |
·參考文獻(xiàn) |
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1. Kenji Fujino;Hiroshi Sekiguchi Origins of functional nucleotide polymorphisms in a major quantitative trait locus, qLTG3-1, controlling low-temperature germinability in rice Plant Molecular Biology, 2011, 75(1-2): 1-10 |
2. Kenji Fujino;Yasuyuki Matsuda Genome-wide analysis of genes targeted by qLTG3-1 controlling low-temperature germinability in rice Plant Molecular Biology, 2010, 72(1-2): 137-152 |
3. Kenji Fujino;Yasuyuki Matsuda 64. Global expression profiling of genes targeted by qLTG3-1 controlling low temperature tolerance at the germination stage in rice Cryobiology, 2009, 59(3): 387-388 |
4. Kenji Fujino;Hiroshi Sekiguchi;Yasuyuki Matsuda;Kazuhiko Sugimoto;Kazuko Ono;Masahiro Yano Molecular identification of a major quantitative trait locus, qLTG3-1, controlling low-temperature germinability in rice Proceedings of the National Academy of Sciences, 2008, 105(34): 12623-12628 |
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