·常規(guī)信息  最近更新：2024年6月14日 5:16:00
                基因(座)名稱自噬相關(guān)基因
                autophagy associated gene
                基因符號(hào)OsATG8b
                所在染色體4 （已克�。�
                OsATG8b(qPCR-primers: 5'-GCTCCTTGTCCGATTTGGTG/TGTTAGCCTCAGCCTGCCTC-3', Fan et al. 2020; AK121268/NM001060464, Izumi et al. 2015; LOC_Os04g53240, Guo et al. 2023, Zhen et al. 2019)...
                

                【生物學(xué)功能】
                

                自噬基因OsATG8b參與氮素轉(zhuǎn)運(yùn)和稻米品質(zhì)調(diào)控。7日齡OsATG8b RNAi幼苗的根比野生型中花11和OsATG8b過(guò)表達(dá)系短得多，但30日齡和60日齡時(shí)無(wú)顯著表型差異。相比野生型中花11，OsATG8b過(guò)表達(dá)系的自噬活性升高，單株粒數(shù)和產(chǎn)量增加，可溶性蛋白質(zhì)含量高，籽粒氮循環(huán)效率較高，而OsATG8b RNAi系相反，且穎殼有褐色斑點(diǎn)，堊白率升高，品質(zhì)差（Fan et al. 2020）。
                

                過(guò)表達(dá)OsATG8b導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)氮饑餓耐受性增強(qiáng)，并提高產(chǎn)量和氮利用效率（Zhen et al. 2019）。
                

                【時(shí)空表達(dá)譜】
                

                qRT-PCR分析發(fā)現(xiàn)，OsATG8b在所有檢測(cè)器官中均表達(dá)，包括不同生長(zhǎng)階段的根、莖、葉片、葉鞘和穗。缺氮和黑暗處理上調(diào)OsATG8b表達(dá)（Fan et al. 2020）。
                

                【亞細(xì)胞定位】
                

                自噬體（Fan et al. 2020）。
                【相關(guān)登錄號(hào)】
                contigs及其產(chǎn)物：AP014960↘BAS91092
                cDNAs及其產(chǎn)物：AK121268→BAH00402
                NCBI GenBank ESTs：CI414951, CI757284, CV152501
                參考基因組位點(diǎn)：Os04g0624000（RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)）←→ LOC_Os04g53240（本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)）←→ LOC4337052（NCBI）
                參考基因組產(chǎn)物：XM_015781608→XP_015637094
                uniprot庫(kù)登錄號(hào)：A2XXR7, B7F704, Q7XPR1, Q01KB9
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征根長(zhǎng)度(TO:0000227), 氮素敏感性(TO:0000011), 穎殼顏色(TO:0000706), 可溶性蛋白含量(TO:0000325), 堊白胚乳(TO:0000266), 單株粒數(shù)(TO:0000440), 單株產(chǎn)量(TO:0000449), 氮肥利用率(TO:0020100)
                生物進(jìn)程暗應(yīng)答(GO:0009646), 自噬(GO:0006914), 氮素利用(GO:0019740), 氮饑餓的細(xì)胞反應(yīng)(GO:0006995), 根發(fā)育調(diào)控(GO:2000280)
                ·參考文獻(xiàn)
                1. Jianping Guo;Huiying Wang;Wei Guan;Qin Guo;Jing Wang;Jing Yang;Yaxin Peng;Junhan Shan;Mingyang Gao;Shaojie Shi;Xinxin Shangguan;Bingfang Liu;Shengli Jing;Jing Zhang;Chunxue Xu;Jin Huang;Weiwei Rao;Xiaohong Zheng;Di Wu;Cong Zhou;Bo Du;Rongzhi Chen;Lili Zhu;Yuxian Zhu;Linda L. Walling;Qifa Zhang;Guangcun He
                  A tripartite rheostat controls self-regulated host plant resistance to insects
                  Nature, 2023, 618: 799-807
                2. Tian Fan;Wu Yang;Xuan Zeng;Xinlan Xu;Yanling Xu;Xiaorong Fan;Ming Luo;Changen Tian;Kuaifei Xia;Mingyong Zhang
                  A Rice Autophagy Gene OsATG8b Is Involved in Nitrogen Remobilization and Control of Grain Quality
                  Frontiers in Plant Science, 2020, 11: 588
                3. Xiaoxi Zhen;Fan Xu;Wenzhong Zhang;Nan Li;Xin Li
                  Overexpression of rice gene OsATG8b confers tolerance to nitrogen starvation and increases yield and nitrogen use efficiency (NUE) in Arabidopsis
                  PLoS ONE, 2019, 14(9): e0223011
                4. Masanori Izumi;Jun Hidema;Shinya Wada;Eri Kondo;Takamitsu Kurusu;Kazuyuki Kuchitsu;Amane Makino;Hiroyuki Ishida
                  Establishment of Monitoring Methods for Autophagy in Rice Reveals Autophagic Recycling of Chloroplasts and Root Plastids during Energy Limitation
                  Plant Physiology, 2015, 167(4): 1307-1320
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