·常規(guī)信息  最近更新:2023年5月31日 21:07:00
                基因(座)名稱孕穗期耐冷QTL
                Cold tolerance at booting stage-1
                基因符號Ctb1
                所在染色體4 (已克隆)

                水稻在孕穗期如果遇上低溫會導(dǎo)致雄性不育,進而造成減產(chǎn)。作者在以前的研究中定位到一個耐冷QTL Ctb1,并將其精細定位到56kb 的范圍內(nèi),該區(qū)間共有7 個候選基因。在本文中作者進一步將基因定位到17kb 的范圍內(nèi),其中包含兩個候選基因,一個編碼F-box 蛋白,另一個編碼絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶。其中F-box 蛋白基因主要在幼穗表達,絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶基因在葉片和幼穗表達。從耐冷品種Norin-PL8 中克隆到這兩個基因,分別轉(zhuǎn)進一個冷敏感的品種Hokkai241 和一個冷敏感株系BT4-74-8 中。通過考察冷水灌溉(19℃, 25 cm)和冷氣(12℃, 4 days)處理的T2、T3轉(zhuǎn)基因后代的結(jié)實率,獲得了耐冷轉(zhuǎn)基因植株,證明F-box 蛋白基因是耐冷基因。耐冷性是和花藥長度相關(guān)聯(lián)的,轉(zhuǎn)基因植株和對照相比花藥長度較長。F-box 蛋白和一個E3 泛素連接酶亞基Skp1 互作,表明泛素-蛋白酶體途徑可能參與了孕穗期的冷耐受過程(Saito et al., 2010)。

                【相關(guān)登錄號】
                contigs及其產(chǎn)物:AP014960BAS91043, BAS91044, BAS91045, BAS91046, BAS91047
                cDNAs及其產(chǎn)物:AK065137BAG89381, AK061943
                參考基因組位點:Os04g0619300(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os04g52830(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC9270188(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015780763XP_015636249
                uniprot庫登錄號:A0A0D9ZQT6, A0A0E0H638, A0A0E0PE64, B7EAI4, B8AUG2, I1PPZ4, Q7XTU2, Q9SC69
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征耐寒性(TO:0000303)
                生物進程蛋白質(zhì)泛素化(GO:0016567), 低溫脅迫應(yīng)答(GO:0009409)
                細胞結(jié)構(gòu)SCF泛素連接酶復(fù)合物(GO:0019005)
                形態(tài)構(gòu)造孕穗期(GRO:0007148)
                ·參考文獻
                1Koji Saito;Yuriko Hayano-Saito;Makoto Kuroki;Yutaka Sato
                  Map-based cloning of the rice cold tolerance gene Ctb1
                  Plant Science, 2010, 179(1-2): 97-102
                2K. Saito;K. Miura;K. Nagano;Y. Hayano-Saito;H. Araki;A. Kato
                  Identification of two closely linked quantitative trait loci for cold tolerance on chromosome 4 of rice and their association with anther length
                  Theoretical and Applied Genetics, 2010, 103(6-7): 862-868
                3K. Saito;Y. Hayano-Saito;W. Maruyama-Funatsuki;Y. Sato;A. Kato
                  Physical mapping and putative candidate gene identification of a quantitative trait locus Ctb1 for cold tolerance at the booting stage of rice
                  Theoretical and Applied Genetics, 2004, 109(3): 515-522
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