| ·常規(guī)信息 最近更新：2020年11月6日 13:36:00 | |||||||||||||
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| 基因(座)名稱 | 籽粒大小 regulator of grain size | ||||||||||||
| 基因符號(hào) | GS5 | ||||||||||||
| 所在染色體 | 5 （已克隆） | ||||||||||||
GS5(JN256055/JN256056, Li et al. 2016)... GS5編碼一個(gè)絲氨酸羧肽酶，正向調(diào)控水稻籽粒大小。 【突變體表型】GS5高表達(dá)具有更大的籽粒（Li et al. 2011; Xu et al. 2015）。 【定位與克隆】GS5位于第5染色體短臂的RM593和RM574之間。 【時(shí)空表達(dá)譜】GS5等位基因具有節(jié)律性，在白天轉(zhuǎn)錄逐步增加。GS5在綠色組織中的表達(dá)量通常高于非綠色組織如莖稈、根、幼穗以及胚乳；非綠色組織中，GS5最高的表達(dá)量主要在長(zhǎng)度為1-11cm的幼穗中；開花階段，外稃/內(nèi)稃中GS5表達(dá)量顯著上調(diào)（Xu et al. 2015）。 【亞細(xì)胞定位】
【生物學(xué)功能】GS5編碼一個(gè)絲氨酸羧肽酶，是一個(gè)控制水稻粒寬、充實(shí)度和千粒重的數(shù)量性狀基因（Li et al. 2011）。 GS5啟動(dòng)子區(qū)域的兩個(gè)關(guān)鍵單核苷酸多態(tài)性(SNPs)造成水稻幼穗中GS5的差異表達(dá)，這決定了籽粒大小的差異。GS5表達(dá)增強(qiáng)會(huì)通過占據(jù)OsBAK1-7的胞外富亮氨酸重復(fù)(LRR)結(jié)構(gòu)域，競(jìng)爭(zhēng)性地抑制OsBAK1-7和OsMSBP1間的互作，進(jìn)而阻止OsBAK1-7與OsMSBP1互作而產(chǎn)生的胞吞作用（Xu et al. 2015）。 【相關(guān)登錄號(hào)】
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| ·ONTOLOGY及相關(guān)基因 | |
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| 表型特征 | 籽粒大小(TO:0000397), 種子發(fā)育特征(TO:0000653), 籽粒產(chǎn)量(TO:0000396), 粒寬(TO:0000402), 千粒重(TO:0000592) |
| 分子功能 | 絲氨酸羧肽酶活性(GO:0004185) |
| 生物進(jìn)程 | 細(xì)胞分裂的正向調(diào)節(jié)(GO:0051781), 種子發(fā)育(GO:0048316), 胞吞作用調(diào)節(jié)(GO:0030100) |
| ·參考文獻(xiàn) |
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| 1. Chunjue Xu;Yu Liu;Yibo Li;Xiaodong Xu;Caiguo Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Qifa Zhang Differential expression of GS5 regulates grain size in rice Journal of Experimental Botany, 2015, 66(9): 2611-2623 |
| 2. Yibo Li;Chuchuan Fan;Yongzhong Xing;Yunhe Jiang;Lijun Luo;Liang Sun;Di Shao;Chunjue Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Yuqing He;Qifa Zhang Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in rice Nature Genetics, 2011, 43(12): 1266-1269 |
| 3. Xing Y Z;Tan Y F;Hua J P;Sun X L;Xu C G Characterization of the main effects, epistatic effects and their environmental interactions of QTLs on the genetic basis of yield traits in rice Theoretical and Applied Genetics, 2002, 105(2-3): 248-257 |
| 4. Li J X;Yu S B;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F Analyzing quantitative trait loci for yield using a vegetatively replicated F2 population from a cross between the parents of an elite rice hybrid Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(1-2): 248-254 |
| 5. Y. F. Tan;Y. Z. Xing;J. X. Li;S. B. Yu;C. G. Xu;Qifa Zhang Genetic bases of appearance quality of rice grains in Shanyou 63, an elite rice hybrid Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(5-6): 823-829 |
| 6. Yu S B;Li J X;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F;Saghai Maroof M A Importance of epistasis as the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid Proceedings of the National Academy of Sciences, 1997, 94(17): 9226-9231 |
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