·常規(guī)信息  最近更新:2024年9月4日 14:45:00
                基因(座)名稱稻瘟病抗性基因
                Rice blast resistance-ta
                基因符號Pita; Pi-4a
                所在染色體12 (已克隆)

                Pi-ta 基因與水稻稻瘟病抗性相關(guān)。

                【基因的定位】

                Pi-ta 基因定位于水稻第12 染色體上RFLP 標(biāo)記RG241 和RZ397 之間,遺傳距離分別是5.2cM 和3.3cM(Hittalmani et al., 2000)。

                Pi-ta 基因位于水稻第12染色體靠近著絲點附近的區(qū)域,定位于BAC克隆BAC142E8上(Bryan et al., 2000)。

                【基因的克隆與生物學(xué)功能分析】

                Pi-ta 基因包含2個外顯子和1個1463bp 的內(nèi)含子,編碼一個長度為928 個氨基酸的細胞質(zhì)膜受體蛋白,該蛋白含NBS結(jié)構(gòu)域和富亮氨酸結(jié)構(gòu)域(LRD),Pi-ta 位點上的抗感兩基因的編碼產(chǎn)物僅有一個氨基酸的差異,即第918氨基酸由抗病產(chǎn)物的丙氨酸變異為感病產(chǎn)物的絲氨酸,其抗病機制是Pi-ta 基因的編碼產(chǎn)物能與稻瘟病菌的無毒基因AVR-Pita 表達產(chǎn)物相互作用引發(fā)抗病反應(yīng)(Bryan et al., 2000)。

                Pi-ta2Pi-ta 等位,且抗譜比Pi-ta 廣。通過對Pi-ta 的克隆,發(fā)現(xiàn)Pi-ta2 實際上就是Pi-ta 至少加上1個緊密連鎖的其它抗性基因(Bryan et al., 2000)。

                Pi-ta 介導(dǎo)的稻瘟病抗性必須有Ptr(t) 的參與。Ptr(t) 是一個單顯性基因,與Pi-ta 連鎖并共分離,它們位于一個9Mb 的區(qū)域并且都是秈型起源。Ptr(t) 可能特異性的在Pi-ta 介導(dǎo)的信號識別中發(fā)揮作用(Jia et al., 2008)。

                稻瘟病抗性基因產(chǎn)物Pi-ta 與無毒基因產(chǎn)物AVR-Pita 直接互作(Jia et al., 2000)。

                【相關(guān)登錄號】
                contigs及其產(chǎn)物:AP014968BAT16708, BAT16709, BAT16710
                基因及產(chǎn)物ID號:AB364496BAF91352, AF207842AAK00132, AY196754AAO45178
                cDNAs及其產(chǎn)物:AK071926BAG92756, GQ463467ACV87221, GQ463468ACV87222, GQ463473ACV87223, GQ463474ACV87224, AK066558, AK067534
                參考基因組位點:Os12g0281300(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os12g18360(本地MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)←→ LOC4351983(NCBI)
                參考基因組產(chǎn)物:XM_015765156XP_015620642, XM_015765157XP_015620643
                uniprot庫登錄號:A0A8J8YGA0, B8BP45, B9GCN6, Q0INX2, Q2QTV8
                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征葉瘟抗性(TO:0000468), 穗頸瘟抗性(TO:0000477), 氣孔關(guān)閉時間(TO:0000521)
                分子功能腺苷-5'-三磷酸結(jié)合(GO:0005524)
                生物進程防衛(wèi)反應(yīng)(GO:0006952), 抗真菌先天免疫反應(yīng)(GO:0061760), 效應(yīng)子觸發(fā)的植物免疫反應(yīng)(GO:0080185)
                細胞結(jié)構(gòu)質(zhì)體(GO:0009536)
                形態(tài)構(gòu)造營養(yǎng)生長階段(GRO:0007139), 維管葉(PO:0009025)
                ·參考文獻
                1Seonghee Lee;Yulin Jia;Melissa Jia;David R. Gealy;Kenneth M. Olsen;Ana L. Caicedo
                  Molecular Evolution of the Rice Blast Resistance Gene Pi-ta in Invasive Weedy Rice in the USA
                  PLoS ONE, 2011, 6(10): e26260
                2X. Wang;R. Fjellstrom;Y. Jia;W. G. Yan;M. H. Jia;B. E. Scheffler;D. Wu;Q. Shu;A. McClung
                  Characterization of Pi-ta blast resistance gene in an international rice core collection
                  Plant Breeding, 2010, 129(5): 491-501
                3Stefano Costanzo;Yulin Jia
                  Alternatively spliced transcripts of Pi-ta blast resistance gene in Oryza sativa
                  Plant Science, 2009, 177(5): 468-478
                4Yulin Jia;Rodger Martin
                  Identification of a New Locus, Ptr(t), Required for Rice Blast Resistance Gene Pi-ta–Mediated Resistance
                  Molecular Plant-Microbe Interactions, 2008, 21(4): 396-403
                5Chun-Lin Huang;Shih-Ying Hwang;Yu-Chung Chiang;Tsan-Piao Lin
                  Molecular Evolution of the Pi-ta Gene Resistant to Rice Blast in Wild Rice (Oryza rufipogon)
                  Genetics, 2008, 179(3): 1527-1538
                6王忠華;賈育林;吳殿星;夏英武
                  水稻抗稻瘟病基因Pi-ta的分子標(biāo)記輔助選擇
                  作物學(xué)報, 2004, 30(12): 1259-1265
                7Yulin Jia;Zhonghua Wang;Pratibha Singh
                  Development of dominant rice blast Pi-ta resistance gene markers
                  Crop Science, 2002, 42(6): 2145-2149
                8Yulin Jia;Sean A. McAdams;Gregory T. Bryan;Howard P. Hershey;Barbara Valent
                  Direct interaction of resistance gene and avirulence gene products confers rice blast resistance
                  The EMBO Journal, 2000, 19(15): 4004-4014
                9Gregory T. Bryan;Kun-Sheng Wu;Leonard Farrall;Yulin Jia;Howard P. Hershey;Sean A. McAdams;Kristina N. Faulk;Gail K. Donaldson;Renato Tarchini;Barbara Valent
                  A Single Amino Acid Difference Distinguishes Resistant and Susceptible Alleles of the Rice Blast Resistance Gene Pi-ta
                  The Plant Cell, 2000, 12(11): 2033-2046
                10Hittalmani-S;Parco-A;Mew-T-V;Zeigler-R-S;Huang-N
                  Fine mapping and DNA marker-assisted pyramiding of the three major genes for blast resistance in rice
                  Theoretical and Applied Genetics, 2000, 100(7): 1121-1128
                11Inukai T;Zeigler R S;Sarkarung S;Bronson M;Dung L V;Kinoshita T;Nelson R J
                  Development of pre-isogenic lines for rice blast-resistance by marker-aided selection from a recombinant inbred population
                  Theoretical and Applied Genetics, 1996, 93(4): 560-567
                中國水稻研究所
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