·常規(guī)信息  最近更新:2017年5月13日 15:29:00
                基因(座)名稱光溫敏雄性核不育基因
                Photoperiod-sensitive male sterility-3
                基因符號pms3; p/tms12-1; IncRNA; LDM
                所在染色體12 (已克。

                控制粳稻農(nóng)墾58S光敏型雄性不育和控制秈稻培矮64S溫敏雄性不育的基因,克隆證實(shí)它們位于同一個(gè)位點(diǎn),是一個(gè)非編碼RNA。

                【基因的發(fā)現(xiàn)、命名與定位】

                以“農(nóng)墾58S×農(nóng)墾58”及“農(nóng)墾58S×1514”兩個(gè)F2 群體為材料,通過BSA分析找到了農(nóng)墾58S 所攜帶的另1個(gè)光敏核不育基因pms3,并將其定位于第12 染色體上(梅明華等, 1999);對農(nóng)墾58S/大黑矮生標(biāo)記基因系FL2 組合組建可育集團(tuán)和不育集團(tuán),并以親本對照進(jìn)行了RFLP、RAPD和雙引物RAPD分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)第12 染色體的1個(gè)單拷貝標(biāo)記G2140 與光敏核不育基因連鎖遺傳,二者之問的遺傳圖距為14.1cM(李子銀等, 1999);陳亮等篩選出與光敏不育基因pms3 連鎖的標(biāo)記F3和V4,其與pms3 的遺傳距離分別為5.80cM和7.75cM;李香花等則進(jìn)一步將pms3 定位在12號染色體上的RFLP標(biāo)記M36和RZ261之間,與兩標(biāo)記的遺傳距離分別為1.5cM 和3.05cM。

                【基因的克隆、功能研究】

                華中農(nóng)業(yè)大學(xué)張啟發(fā)研究團(tuán)隊(duì)指出控制農(nóng)墾58S不育的是一個(gè)長的非編碼RNA,LOC_12g36030 的轉(zhuǎn)錄本1即pms3。研究表明一個(gè)長度為1236bp,且與長光照下特異的雄性不育相關(guān)的RNA分子(LDMAR)。長日照條件下,足夠的LDMAR 轉(zhuǎn)錄量是維持正常花粉發(fā)育所必需的,但由于一個(gè)單堿基突變造成LDMAR 二級結(jié)構(gòu)改變,導(dǎo)致了LDMAR 在特異的長日照下轉(zhuǎn)錄量降低,造成正處于發(fā)育的花藥提前程序化死亡,即產(chǎn)生PSMS(Ding et al. 2012)。

                華南農(nóng)業(yè)大學(xué)莊楚雄課題組的論文進(jìn)一步指出,p/tms12-1 是一個(gè)非編碼RNA基因,它的原始轉(zhuǎn)錄本經(jīng)過至少2次加工產(chǎn)生一個(gè)小RNA。與正常水稻品種相比,溫敏不育水稻在該小RNA序列內(nèi)存在一個(gè)單堿基突變。研究結(jié)果進(jìn)一步表明,“農(nóng)墾58S”也具有相同的該突變基因,這個(gè)單堿基突變是在秈稻產(chǎn)生溫敏不育性和在粳稻產(chǎn)生光敏不育性的共同原因。在正常水稻中,野生型P/TMS12-1 的表達(dá)抑制了溫敏或光敏不育的發(fā)生,而溫敏和光敏不育水稻中,p/tms12-1 的該突變影響了小RNA的表達(dá)水平及其可能與靶基因的互作能力而產(chǎn)生雄性不育(Zhou et al. 2012)。

                【相關(guān)登錄號】
                contigs及其產(chǎn)物:AP014968BAT17532, AP008218BAH95727
                cDNAs及其產(chǎn)物:AK111270, JQ317784, JQ317785
                參考基因組位點(diǎn):Os12g0545900(RAP-DB, PhytoAB公司抗體服務(wù)←→ LOC_Os12g36030(本地、MSU-RGAP, 百格基因突變體服務(wù)
                參考基因組產(chǎn)物:NM_001190070NP_001176999
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                ·ONTOLOGY及相關(guān)基因
                表型特征花粉敗育(TO:0000053), 光敏雄性核不育(TO:0000009), 溫敏雄性核不育(TO:0000067)
                序列特征微RNA(SO:0000276), 長鏈非編碼RNA(SO:0001877)
                生物進(jìn)程花粉發(fā)育(GO:0009555), 絨氈層發(fā)育(GO:0048658)
                ·參考文獻(xiàn)
                1Hai Zhou;Qinjian Liu;Jing Li;Dagang Jiang;Lingyan Zhou;Ping Wu;Sen Lu;Feng Li;Liya Zhu;Zhenlan Liu;Letian Chen;Yao-Guang Liu;Chuxiong Zhuang
                  Photoperiod- and thermo-sensitive genic male sterility in rice are caused by a point mutation in a novel noncoding RNA that produces a small RNA
                  Cell Research, 2012, 22(4): 649-660
                2Jihua Ding;Qing Lu;Yidan Ouyang;Hailiang Mao;Pingbo Zhang;Jialing Yao;Caiguo Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Qifa Zhang
                  A long noncoding RNA regulates photoperiod-sensitive male sterility, an essential component of hybrid rice
                  Proceedings of the National Academy of Sciences, 2012, 109(7): 2654-2659
                3Q. Lu;X. H. Li;D. Guo;C. G. Xu;Q. Zhang
                  Localization of pms3, a gene for photoperiod-sensitive genic male sterility, to a 28.4-kb DNA fragment
                  Molecular Genetics and Genomics, 2005, 273(6): 507-511
                4李香花;王伏林;陸青;徐才國
                  水稻光敏核不育基因pms3的精細(xì)定位
                  作物學(xué)報(bào), 2002, 28(3): 310-314
                5陳亮;梅明華;徐才國;王偉;崔紅
                  鑒定與水稻光敏核不育基因pms3連鎖的AFLP-RFLP標(biāo)記
                  廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版), 2000, 39(4): 421-425
                6Minghua Mei;Liang Chen;Zhihong Zhang;Ziyin Li;Caiguo Xu;Qifa Zhang
                  pms3 is the locus causing the original photoperiod-sensitive male sterility mutation of 'Nongken 58S'
                  Science in China Series C-Life Science, 1999, 42(3): 316-322
                7M. H. Mei;X. K. Dai;C. G. Xua;Qifa Zhang
                  Mapping and Genetic Analysis of the Genes for Photoperiod-Sensitive Genic Male Sterility in Rice Using the Original Mutant Nongken 58S
                  Crop Science, 1999, 39(6): 1711-1715
                8梅明華;陳亮;章志宏;李子銀;徐才國;張啟發(fā)
                  農(nóng)墾58S光敏不育基因突變位點(diǎn)的確定及pms3區(qū)間的進(jìn)一步作圖
                  中國科學(xué)(C輯), 1999, 29(3): 310-315
                中國水稻研究所
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