·常規(guī)信息 最近更新:2021年1月31日 23:35:00 | |||||||||||
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基因(座)名稱 | 短穗基因;小肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 short panicle1;peptide transporter | ||||||||||
基因符號(hào) | SP1; OsNPF4.1 | ||||||||||
所在染色體 | 11 (已克隆) | ||||||||||
SP1(Li et al., 2009), 與OsNPF4.1(Léran et al., 2014), 位于同一個(gè)基因位點(diǎn)... SP1 編碼一個(gè)可能的多肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(peptide transporter, PTR),決定水稻穗長。 水稻的穗型主要取決于一級(jí)枝梗枝和二級(jí)枝梗的數(shù)目和長度,在農(nóng)學(xué)和發(fā)育生物學(xué)上都有重要意義。其中一級(jí)枝梗的位置和數(shù)量在植株從營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)變的過程中就已經(jīng)建立,一些調(diào)控穗分生組織活性的基因參與了這一過程。中國學(xué)者報(bào)道了一個(gè)水稻短穗突變體(short panicle1, sp1),它在稻穗伸長過程中有缺陷。SP1 基因在幼穗的韌皮部中高水平表達(dá),其編碼產(chǎn)物包含一個(gè)具有12個(gè)跨膜域的保守PTR2功能域,SP1-GFP 融合蛋白定位于質(zhì)膜上,因此SP1 編碼一個(gè)屬于多肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明SP1 可能是硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,但是在卵母細(xì)胞和酵母中均未發(fā)現(xiàn)硝酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)活性和由PTR 蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)的其它組分。現(xiàn)有結(jié)果表明,SP1 的轉(zhuǎn)運(yùn)功能需要其它組分的參與或者其在單子葉植物中有未知底物(Li et al., 2009)。 【基因克隆】SP1 cDNA 全長5257bp,5'-UTR: 171; 3'-UTR長度: 450,包含有5 個(gè)外顯子,編碼一個(gè)由626 氨基酸組成多肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白。sp-1-1: 來自中花11γ誘變;sp1-2: 來自日本晴TOS17插入庫,但第3個(gè)外顯子有一段31bp的缺失。 【相關(guān)登錄號(hào)】
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·ONTOLOGY及相關(guān)基因 | |
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表型特征 | 穗長(TO:0000040) |
分子功能 | 多肽轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白活性(GO:0015197) |
生物進(jìn)程 | 穗發(fā)育(GO:0010229) |
細(xì)胞結(jié)構(gòu) | 質(zhì)膜(GO:0005886) |
·參考文獻(xiàn) |
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1. Sophie Léran;Kranthi Varala;Jean-Christophe Boyer;Maurizio Chiurazzi;Nigel Crawford;Françoise Daniel-Vedele;Laure David;Rebecca Dickstein;Emilio Fernandez;Brian Forde;Walter Gassmann;Dietmar Geiger;Alain Gojon;Ji-Ming Gong;Barbara A. Halkier;Jeanne M. Harris;Rainer Hedrich;Anis M. Limami;Doris Rentsch;Mitsunori Seo;Yi-Fang Tsay;Mingyong Zhang;Gloria Coruzzi;Benoît Lacombe A unified nomenclature of NITRATE TRANSPORTER 1/PEPTIDE TRANSPORTER family members in plants Trends in Plant Science, 2014, 19(1): 5-9 |
2. Li Shengben;Qian Qian;Fu Zhiming;Zeng Dali;Meng Xiangbing;Kyozuka Junko;Maekawa Masahiko;Zhu Xudong;Zhang Jian;Li Jiayang;Wang Yonghong Short panicle1 encodes a putative PTR family transporter and determines rice panicle size The Plant Journal, 2009, 58(4): 592-605 |
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