·常規(guī)信息 最近更新:2022年2月15日 10:40:00 | |||||||||||
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基因(座)名稱 | 直立穗基因; 大穗基因; F-box蛋白 erect panicle 3; LARGER PANICLE; ORYZA SATIVA F-BOX KELCH 1 | ||||||||||
基因符號(hào) | EP3; LP | ||||||||||
所在染色體 | 2 (已克。 | ||||||||||
EP3(Os02g15950, Yu et al. 2015; LOC_Os02g15950, Piao et al. 2009), LP(LOC_Os02g15950, Li et al. 2011), 位于同一基因位點(diǎn)... 【突變體表型】ep3突變體花梗中小維管束數(shù)量和穗軸粗壯度顯著增加,表現(xiàn)為直立穗(Piao et al. 2009)。 lp的2個(gè)突變體的花枝梗增多,尤其是一級(jí)枝梗數(shù)目,籽粒數(shù)增加,突變體較野生型更抗倒伏,每株籽粒產(chǎn)量也相應(yīng)增加(Li et al. 2011)。 除了穗直立,Os02g15950功能缺失突變體的葉片光合能力和氣孔導(dǎo)度均減弱,氣孔保衛(wèi)細(xì)胞小于野生型(Yu et al. 2015)。 【定位與克隆】ep3位于2號(hào)染色體短臂上STS標(biāo)記STS5803-5和STS5803-7之間的0.1cM區(qū)間,約46.8kb區(qū)間,包含6個(gè)侯選基因,通過DNA序列比較,與野生型相比,突變體的LOC_Os02g15950基因第2外顯子有個(gè)單堿基突變,推測(cè)這是一個(gè)無(wú)義突變(Piao et al. 2009)。 【時(shí)空表達(dá)譜】LP編碼一個(gè)富含Kelch的F-box蛋白,原位雜交表明該LP集中在枝梗原基區(qū)域表達(dá)(Li et al. 2011)。 【亞細(xì)胞定位】內(nèi)質(zhì)網(wǎng) 【生物學(xué)功能】EP3在調(diào)節(jié)氣孔保衛(wèi)細(xì)胞發(fā)育和氣孔導(dǎo)度中起作用,進(jìn)而調(diào)控水稻的光合作用能力(Yu et al. 2015)。 EP3是一個(gè)Fox蛋白,可能作為E3泛素連接酶的一個(gè)亞基,在識(shí)別和降解特定底物中發(fā)揮功能(Yu et al. 2015);LP能與SKP1-like蛋白互作,調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂素氧化酶OsCKX2的水平,可能參與植物組織的細(xì)胞分裂素水平的調(diào)節(jié),對(duì)改善水稻株型、提高產(chǎn)量有作用(Li et al. 2011)。 EP3和OsFBK1會(huì)影響水稻株型、器官大小、花器官數(shù)量和大小、花形態(tài)、花粉活力、籽粒大小和重量等諸多性狀。EP3和OsFBK1可能拮抗調(diào)節(jié)籽粒大小和重量(Borna et al. 2022)。 【相關(guān)登錄號(hào)】
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·ONTOLOGY及相關(guān)基因 | |
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表型特征 | 株高(TO:0000207), 氣孔導(dǎo)度(TO:0000522), 穗形(TO:0000262), 花粉育性(TO:0000421), 根長(zhǎng)度(TO:0000227), 穗長(zhǎng)(TO:0000040), 分蘗數(shù)(TO:0000346), 小花形態(tài)解剖學(xué)性狀(TO:0000274), 穗型(TO:0000089), 每穗粒數(shù)(TO:0002759), 每穗實(shí)粒數(shù)(TO:0000447), 花器官發(fā)育特征(TO:0006022), 抗倒性(TO:0000068), 光合能力(TO:0000316), 小維管束數(shù)目(TO:0000558), 千粒重(TO:0000592), 一次枝梗數(shù)(TO:0000547), 單株產(chǎn)量(TO:0000449) |
分子功能 | 蛋白質(zhì)結(jié)合(GO:0005515) |
生物進(jìn)程 | 穗發(fā)育(GO:0010229), 細(xì)胞分裂素代謝(GO:0009690), 花粉發(fā)育(GO:0009555), 花器官發(fā)育(GO:0048437), 泛素和SCF依賴的蛋白酶體蛋白分解代謝過程(GO:0031146), 氣孔發(fā)育(GO:0010374), 光合作用調(diào)控(GO:0010109), 分蘗形成調(diào)控(GO:2000032), 種子發(fā)育調(diào)控(GO:0080050), 根發(fā)育調(diào)控(GO:2000280) |
細(xì)胞結(jié)構(gòu) | SCF類泛素連接酶復(fù)合物(GO:0019005) |
·參考文獻(xiàn) |
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1. Rita S. Borna;Erik H. Murchie;Kevin A. Pyke;Jeremy A. Roberts;Zinnia H. Gonzalez-Carranza The rice EP3 and OsFBK1 E3 ligases alter plant architecture and flower development, and affect transcript accumulation of microRNA pathway genes and their targets Plant Biotechnology Journal, 2022, 20(2): 297-309 |
2. Hongyang Yu;Erik H. Murchie;Zinnia H. González-Carranza;Kevin A. Pyke;Jeremy A. Roberts Decreased photosynthesis in the erect panicle 3 (ep3) mutant of rice is associated with reduced stomatal conductance and attenuated guard cell development Journal of Experimental Botany, 2015, 66(5): 1543-1552 |
3. Ming Li;Ding Tang;Kejian Wang;Xinru Wu;Lili Lu;Hengxiu Yu;Minghong Gu;Changjie Yan;Zhukuan Cheng Mutations in the F-box gene LARGER PANICLE improve the panicle architecture and enhance the grain yield in rice Plant Biotechnology Journal, 2011, 9(9): 1002-1013 |
4. Rihua Piao;Wenzhu Jiang;Tae-Ho Ham;Min-Seon Choi;Yongli Qiao;Sang-Ho Chu;Jung-Hyun Park;Mi-Ok Woo;Zhengxun Jin;Gynheung An;Joohyun Lee;Hee-Jong Koh Map-based cloning of the ERECT PANICLE 3 gene in rice Theoretical and Applied Genetics, 2009, 119(8): 1497-1506 |
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