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RiceData >>> LOC_Os03g17350 <<< 日本晴

在基因組瀏覽器中顯示LOC_Os03g17350

·基因鑒定

位點(diǎn)名稱(chēng)：

LOC_Os03g17350

基因產(chǎn)物：

white-brown complex homolog protein, putative, expressed

·基因特征

染色體：

Chr03

基因位置：

9654330-9657056 ( + strand)

可變剪接（0個(gè)）：

剪接本	CDS坐標(biāo)	核苷酸長(zhǎng)度	預(yù)測(cè)蛋白長(zhǎng)度	預(yù)測(cè)分子量	預(yù)測(cè)pI	序列
LOC_Os03g17350.1	9654375 ~ 9656738	2364	788	curing	curing	下載

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·基因結(jié)構(gòu)

·GO電子注釋?zhuān)℅ene Ontology）

LOC_Os03g17350.1
GO登錄號(hào)	類(lèi)型	名稱(chēng)（描述）	Code	With
GO:0009987	生物學(xué)進(jìn)程	cellular process	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0016787	分子功能	hydrolase activity	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0005215	分子功能	transporter activity	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0009056	生物學(xué)進(jìn)程	catabolic process	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0006139	生物學(xué)進(jìn)程	nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0006810	生物學(xué)進(jìn)程	transport	IEA	TAIR:AT3G53510
GO:0016020	細(xì)胞組成	membrane	IEA	TAIR:AT3G53510

·Interpro蛋白功能預(yù)測(cè)

LOC_Os03g17350.1
方法	登錄號(hào)	名稱(chēng)（描述）	Interpro登錄號(hào)	起始匹配位點(diǎn)	終止匹配位點(diǎn)	E值
Gene3D	G3DSA:3.40.50.300	no description	N/A	157	369	1.8e-37
HMMPanther	PTHR19241	ATP-BINDING CASSETTE TRANSPORTER	N/A	70	786	N/A
HMMPanther	PTHR19241:SF20	ATP-BINDING CASSETTE TRANSPORTER PLANT	N/A	70	786	N/A
HMMPfam	PF00005	ABC_tran	IPR003439	182	310	3e-15
HMMPfam	PF01061	ABC2_membrane	IPR013525	484	691	1.2e-37
HMMSmart	SM00382	no description	IPR003593	167	359	3e-10
PatternScan	PS00211	ABC_TRANSPORTER_1	IPR017871	282	296	N/A
ProfileScan	PS50893	ABC_TRANSPORTER_2	IPR003439	121	382	19.088
Seg	seg	seg	N/A	96	114	N/A
Seg	seg	seg	N/A	277	291	N/A
Seg	seg	seg	N/A	346	355	N/A
Seg	seg	seg	N/A	455	473	N/A
superfamily	SSF52540	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases	N/A	120	369	6.1e-48
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	501	520	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	533	555	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	575	597	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	602	624	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	639	661	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	728	745	N/A
TMHMM	tmhmm	transmembrane_regions	N/A	760	782	N/A

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